迅速なタンパク質および RNA の消化用の RapiZyme 酵素

迅速なタンパク質および RNA の消化用の RapiZyme 酵素

ウォーターズの RapiZyme 酵素は、タンパク質および核酸医薬品の正確で高効率の消化を実現し、LC-MS ワークフローでのこれらの生物物理学的特性解析および定量をサポートします。

ウォーターズの RapiZyme 酵素は、タンパク質および核酸医薬品の正確で高効率の消化を実現し、LC-MS ワークフローでのこれらの生物物理学的特性解析および定量をサポートします。


概要

ペプチドマッピングおよびオリゴヌクレオチドマッピングは、タンパク質や RNA 医薬品などの複雑な生体分子のアイデンティティー、純度、配列を確認するために不可欠なプロセスです。RapiZyme 酵素は、最新のバイオ医薬品の LC-MS 分析用に設計されており、以下について、迅速で再現性のある消化を実現します。

  • 迅速で高カバー率のペプチドマッピング用の自己消化耐性トリプシン
  • mRNA/sgRNA のシーケンシング用のジヌクレオチド特異的 RNase(MC1、クサチビン)
  • タンパク質消化用の高活性、ヌクレアーゼフリーの遺伝子組み換えプロテイナーゼ K

これらのツールにより、最新のバイオ医薬品について、LC-MS ユーザーのための、頑健で高分解能の特性解析ワークフローが可能になります。ウォーターズのソリューションにより、サンプルの処理時間とラボの運用が改善し、重要な判断を確信を持って迅速に行えます。


ソリューション


迅速かつクリーンで、完全なタンパク質消化を達成

迅速かつクリーンで、完全なタンパク質消化を達成

ペプチドマッピング用の迅速でクリーン、かつ完全なタンパク質消化を実現します。RapiZyme トリプシンは化学的に最適化された遺伝子組み換えトリプシンであり、TPCK 阻害剤処理が不要であるため、再現性のある結果と高い回収率が得られます。ピーク形状やベースラインを損なうことなく、わずか 30 分で信頼性の高いデータが得られます。 

  • Peptide Mapping
  • 研究・探索的プロテオミクス
  • バイオアナリシス

核酸のバイオアナリシスのための迅速で効率的なタンパク質除去を実現

核酸のバイオアナリシスのための迅速で効率的なタンパク質除去を実現

界面活性剤を含まずヌクレアーゼフリーで、LC-MS に適合し、非常に高活性の遺伝子組み換えプロテイナーゼ K 消化モジュールを使用することで、効率的なタンパク質消化が実現します。プロテイナーゼ K 消化モジュールは、バイオアナリシスアプリケーション用のオリゴヌクレオチドの抽出に最適であり、ウイルスベクターのカプセル化効率の分析や、遊離核酸とカプセル化核酸の比の決定をサポートします。

  • RNA シーケンシング
  • バイオアナリシス

シチジン特異性を有する調整可能な RNA 消化

シチジン特異性を有する調整可能な RNA 消化

LC-MS シーケンシングのための部分的 RNA 消化。シチジンの 3' 末端で切断してシーケンスカバー率が高くなり、確実な割り当てが可能になる組み換えエンドオリボヌクレアーゼである RapiZyme クサチビンを使用することで、LC-MS シーケンシングが加速します。

  • RNA シーケンシング
  • バイオアナリシス

LC-MS シーケンシング用に、選択的で再現性のある RNA 消化を実現

LC-MS シーケンシング用に、選択的で再現性のある RNA 消化を実現

RapiZyme MC1 を使用してシーケンスカバー率を改善します。この遺伝子組み換え RNase は、ウリジンの 5' 末端を切断して独自のプロダクトを生成し、LC-MS のシーケンスカバー率が向上するとともに RapiZyme クサチビンを補完します。 

  • RNA シーケンシング
  • バイオアナリシス

アプリケーション

LC-MS 用の迅速で再現性の高いタンパク質消化酵素である RapiZyme トリプシンを使用することで、わずか 30 分で高いシーケンスカバー率が実現し、きれいなベースラインを得ることができます。この自己消化耐性トリプシンにより、モノクローナル抗体やその他のタンパク質医薬品について、信頼性の高いペプチドマッピングおよびボトムアッププロテオミクスが可能になります。

LC-MS 用の迅速で再現性の高いタンパク質消化酵素である RapiZyme トリプシンを使用することで、わずか 30 分で高いシーケンスカバー率が実現し、きれいなベースラインを得ることができます。この自己消化耐性トリプシンにより、モノクローナル抗体やその他のタンパク質医薬品について、信頼性の高いペプチドマッピングおよびボトムアッププロテオミクスが可能になります。


テーブルにある穀物の入った容器

1:5 消化物の比較(別の業界をリードする他社製品(上のパネル)と RapiZyme トリプシン(下のパネル))。保持時間ウィンドウ 14 ~ 40 分の拡大図も示しています。赤色の矢印は、トリプシンの自己消化物のピークと未知ピークを示しています。

RapiZyme RNase MC1 と RapiZyme クサチビンを使用した、ウリジンおよびシチジンに富んだ部位での調整可能な消化により、オーバーラップした RNA フラグメントを生成して、オリゴヌクレオチドマッピング用の RNA 消化を行うことができます。mRNA ワクチンおよび CRISPR ガイド RNA のシーケンスカバー率とピーク同定が改善します。

RapiZyme RNase MC1 と RapiZyme クサチビンを使用した、ウリジンおよびシチジンに富んだ部位での調整可能な消化により、オーバーラップした RNA フラグメントを生成して、オリゴヌクレオチドマッピング用の RNA 消化を行うことができます。mRNA ワクチンおよび CRISPR ガイド RNA のシーケンスカバー率とピーク同定が改善します。


テーブルにある穀物の入った容器

遺伝子組み換え RapiZyme クサチビンおよび RapiZyme MC1 で消化した HPRT sgRNA の LC-UV-MS 分析。RapiZyme クサチビン(A)および RapiZyme MC1(B)の 3 つの独立した遺伝子組み換え酵素のバッチを使用して HPRT sgRNA を消化し、3 つの UV クロマトグラム(黒線、青線、赤線)を重ね描きしたところ、3 つの調製物の消化挙動に再現性があることが示されました。(C)代表的な TUV トレースにおける存在量を示す、同定された RapiZyme クサチビン消化産物の抽出イオンクロマトグラムの重ね描き。(D)代表的な TUV トレースにおける存在量を示す、同定された RapiZyme MC1 消化産物の抽出イオンクロマトグラムの重ね描き。RapiZyme MC1 消化産物の低存在量消化産物のプロファイルを挿入図に示します。

RapiZyme RNase を使用して mRNA の酵素消化を制御することで、mRNA のアイデンティティー、純度、配列の分析が可能になります。RapiZyme RNase を使用すると、固有の質量を有する長い消化産物が得られ、同重体の消化産物によって生じる場合があるあいまいさの低減に役立ちます。配列の決定に加え、5' キャッピングやポリ A テールの不均一性などの他の重要品質特性(CQA)を、ハイブリダイゼーションやプローブベースのアプローチを必要とせずに評価することができます。  

RapiZyme RNase を使用して mRNA の酵素消化を制御することで、mRNA のアイデンティティー、純度、配列の分析が可能になります。RapiZyme RNase を使用すると、固有の質量を有する長い消化産物が得られ、同重体の消化産物によって生じる場合があるあいまいさの低減に役立ちます。配列の決定に加え、5' キャッピングやポリ A テールの不均一性などの他の重要品質特性(CQA)を、ハイブリダイゼーションやプローブベースのアプローチを必要とせずに評価することができます。  


テーブルにある穀物の入った容器

mRNA 1 の RNase MC1 消化物中のさまざまな型の 5' キャップ付きオリゴヌクレオチドの特性解析(XIC は上のパネル、質量スペクトルは中央のパネル、MSE フラグメントイオンのドットマップは下のパネル)。キャップ付きオリゴヌクレオチド(a)、非メチル化キャップバージョン(b)、キャップなしバージョン(c)の検出。

RapiZyme プロテイナーゼ K を使用することで、迅速な非特異的タンパク質消化が可能になり、複雑なサンプルから核酸を遊離させることができます。この酵素は遺伝子治療のワークフローに最適であり、認定済みヌクレアーゼフリー試薬を使用することで、核酸の回収率が向上し、DMPK 試験がサポートされて、質の高い結果が得られます。

RapiZyme プロテイナーゼ K を使用することで、迅速な非特異的タンパク質消化が可能になり、複雑なサンプルから核酸を遊離させることができます。この酵素は遺伝子治療のワークフローに最適であり、認定済みヌクレアーゼフリー試薬を使用することで、核酸の回収率が向上し、DMPK 試験がサポートされて、質の高い結果が得られます。


テーブルにある穀物の入った容器

豚の脳組織からの GEM91、GEM132、脂質結合アンチセンスオリゴヌクレオチドについての、オリゴヌクレオチド抽出性能の実証。溶媒を用いたプロテイナーゼ K による組織均質化および消化を行い、続いて OligoWorks SPE マイクロプレートと試薬を使用するミックスモード SPE 精製を行って、回収率は 80% 以上であり、再現性に優れていました(SD が 10% 以下)(A)。また、抽出の直線性は、内部標準試料による補正なしで 0.99 以上でした(B)。

RapiZyme トリプシンを使用することで、ハイスループットのタンパク質消化が実現します。ペプチドマッピングアッセイを加速して、アイデンティティーを決定し、翻訳後修飾(PTM)、シーケンスバリアント、分解産物を検出できます。  また、バイオプロセス開発における自動化およびハイスループットの LC-MS ワークフローもサポートします。

RapiZyme トリプシンを使用することで、ハイスループットのタンパク質消化が実現します。ペプチドマッピングアッセイを加速して、アイデンティティーを決定し、翻訳後修飾(PTM)、シーケンスバリアント、分解産物を検出できます。  また、バイオプロセス開発における自動化およびハイスループットの LC-MS ワークフローもサポートします。


テーブルにある穀物の入った容器

探索的 HCP アッセイを使用して、NIST モノクローナル抗体(mAb)消化物中に同定された 2 種類の低存在量 HCP ペプチドの抽出質量クロマトグラム。

Webinar およびリソース


  • アプリケーションノート集

バイオ医薬品のペプチドマッピング

バイオ医薬品のペプチドマッピング
  • インフォグラフィック

RapiZyme - 迅速・クリーン・完全(インフォグラフィック)

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  • インフォグラフィック

RapiZyme – 柔軟性の高い使用(インフォグラフィック)

RapiZyme – 柔軟性の高い使用(インフォグラフィック)
  • オンデマンド Webinar

コードの解読:高度な酵素、質量分析およびインフォマティクスを使用した mRNA および sgRNA の分析

コードの解読:高度な酵素、質量分析およびインフォマティクスを使用した mRNA および sgRNA の分析
  • オンデマンド Webinar

mAb の迅速かつクリーンで完全なペプチドマッピング

mAb の迅速かつクリーンで完全なペプチドマッピング
  • オンデマンド Webinar

MRNA プレイブック

MRNA プレイブック
  • User Manuals

RapiZyme RNase クイックスタートガイド

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関連情報

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迅速なタンパク質および RNA の消化用の RapiZyme 酵素の詳細情報はこちらから。

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