Análisis de oligonucleótidos sintéticos

Análisis de oligonucleótidos sintéticos

Desde la preparación de muestra hasta la separación cromatográfica, pasando por la detección óptica y de masas, y el análisis de datos y la obtención de informes con cumplimiento normativo, las herramientas de Waters para el análisis de oligonucleótidos, especialmente diseñadas para su finalidad específica, ofrecen un rendimiento y una productividad de vanguardia, y cuentan con el respaldo de nuestros equipos de soporte y servicio técnico globales para acelerar sus esfuerzos de desarrollo terapéutico, diagnóstico y de investigación.

Desde la preparación de muestra hasta la separación cromatográfica, pasando por la detección óptica y de masas, y el análisis de datos y la obtención de informes con cumplimiento normativo, las herramientas de Waters para el análisis de oligonucleótidos, especialmente diseñadas para su finalidad específica, ofrecen un rendimiento y una productividad de vanguardia, y cuentan con el respaldo de nuestros equipos de soporte y servicio técnico globales para acelerar sus esfuerzos de desarrollo terapéutico, diagnóstico y de investigación.


Descripción general

El resurgimiento del desarrollo terapéutico de oligonucleótidos ha generado una cartera de proyectos preclínicos/clínicos en rápida expansión. Al trabajar a nivel de transcripción y traducción de genes, estos fármacos de ácidos nucleicos cortos son muy prometedores para muchos trastornos hereditarios y dolencias comunes por igual.

Durante más de una década, Waters ha liderado el desarrollo de herramientas y técnicas avanzadas para la caracterización, la purificación y el bioanálisis de oligonucleótidos sintéticos. Con pasión, dedicación y enfoque, mantenemos nuestro compromiso de ayudar a nuestros clientes a superar sus desafíos analíticos más complicados. Estamos listos para ayudarle a alcanzar sus objetivos de desarrollo de oligonucleótidos sintéticos mediante innovadoras columnas cromatográficas de alto rendimiento; consumibles de preparación de muestras; un conjunto de instrumentos de LC, MS y light scattering; un software listo para el cumplimiento regulatorio; flujos de trabajo basados en aplicaciones; y servicio y asistencia inigualables.


Aplicaciones

Con los productos terapéuticos con oligonucleótidos, la secuencia y la ubicación de los nucleótidos modificados son de vital importancia para su función, estabilidad y eficacia. La fragmentación por LC-MS/MS es una técnica clave que puede proporcionar este nivel de confirmación de secuencias, y las herramientas automatizadas de análisis de datos y generación de informes hacen que el proceso sea rápido y sencillo.

Con los productos terapéuticos con oligonucleótidos, la secuencia y la ubicación de los nucleótidos modificados son de vital importancia para su función, estabilidad y eficacia. La fragmentación por LC-MS/MS es una técnica clave que puede proporcionar este nivel de confirmación de secuencias, y las herramientas automatizadas de análisis de datos y generación de informes hacen que el proceso sea rápido y sencillo.


Notas de aplicación

Notas de aplicación

Los oligonucleótidos sintéticos contienen muchas impurezas relacionadas con el proceso y el producto, incluidas secuencias de error n-X truncadas, variantes oxidadas (p. ej., conversiones de PS a PO) y desaminadas. Para las especies de dsRNA (p. ej., siRNA), los componentes monocatenarios se consideran impurezas. Para las presentaciones normativas, estas impurezas deben identificarse y cuantificarse hasta un mínimo del 0,01 % del producto de longitud completa.

Los oligonucleótidos sintéticos contienen muchas impurezas relacionadas con el proceso y el producto, incluidas secuencias de error n-X truncadas, variantes oxidadas (p. ej., conversiones de PS a PO) y desaminadas. Para las especies de dsRNA (p. ej., siRNA), los componentes monocatenarios se consideran impurezas. Para las presentaciones normativas, estas impurezas deben identificarse y cuantificarse hasta un mínimo del 0,01 % del producto de longitud completa.


Notas de aplicación

Notas de aplicación

El análisis cuantitativo de oligonucleótidos de biofluidos requiere enfoques de preparación de muestra eficaces para lograr la máxima recuperación, reproducibilidad y límites de detección más bajos. Las herramientas de preparación de muestras, cromatografía líquida y espectrometría de masas de Waters están diseñadas para proporcionar la sensibilidad, la repetitibilidad y la productividad necesarias para los proyectos de bioanálisis de oligonucleótidos.

El análisis cuantitativo de oligonucleótidos de biofluidos requiere enfoques de preparación de muestra eficaces para lograr la máxima recuperación, reproducibilidad y límites de detección más bajos. Las herramientas de preparación de muestras, cromatografía líquida y espectrometría de masas de Waters están diseñadas para proporcionar la sensibilidad, la repetitibilidad y la productividad necesarias para los proyectos de bioanálisis de oligonucleótidos.


Notas de aplicación

Notas de aplicación

Las partículas subvisibles y visibles en los oligonucleótidos sintéticos pueden comprometer la seguridad del paciente y provocar costosas retiradas del mercado por parte de la FDA. Con imaging de membrana sobre fondo (BMI) y microscopía de membrana de fluorescencia (FMM), se pueden contar e identificar partículas con alto rendimiento usando solo 5 µL de muestra, lo que ayuda a mitigar los riesgos de forma temprana, garantizar el cumplimiento regulatorio y tomar decisiones con confianza.

Las partículas subvisibles y visibles en los oligonucleótidos sintéticos pueden comprometer la seguridad del paciente y provocar costosas retiradas del mercado por parte de la FDA. Con imaging de membrana sobre fondo (BMI) y microscopía de membrana de fluorescencia (FMM), se pueden contar e identificar partículas con alto rendimiento usando solo 5 µL de muestra, lo que ayuda a mitigar los riesgos de forma temprana, garantizar el cumplimiento regulatorio y tomar decisiones con confianza.


Notas de aplicación

Notas de aplicación

Descubra cómo las columnas preparativas de oligonucleótidos a escala de laboratorio y los consumibles de Waters ofrecen purificaciones directas de escalado ascendente, alta recuperación y alto rendimiento. Cada lote de sorbente, creado con una estabilidad de pH y a la temperatura líder en el sector, se somete a pruebas de QC y se selecciona utilizando patrones de oligonucleótidos de Waters para garantizar el rendimiento y la reproducibilidad entre lotes.

Descubra cómo las columnas preparativas de oligonucleótidos a escala de laboratorio y los consumibles de Waters ofrecen purificaciones directas de escalado ascendente, alta recuperación y alto rendimiento. Cada lote de sorbente, creado con una estabilidad de pH y a la temperatura líder en el sector, se somete a pruebas de QC y se selecciona utilizando patrones de oligonucleótidos de Waters para garantizar el rendimiento y la reproducibilidad entre lotes.


Notas de aplicación

Notas de aplicación


Caso práctico: BioSpring implementa flujos de trabajo LC-MS de Waters para oligonucleótidos para ampliar la cartera existente

Conozca cómo BioSpring aprovechó el sistema BioAccord LC-MS de Waters y Vion IMS QTof con waters_connect, listos para el cumplimiento normativo, para garantizar la integridad de los datos, dar soporte a tiempos de respuesta más cortos y cumplir los requisitos normativos a medida que ampliaba sus servicios de análisis y fabricación de oligonucleótidos.

Conozca cómo BioSpring aprovechó el sistema BioAccord LC-MS de Waters y Vion IMS QTof con waters_connect, listos para el cumplimiento normativo, para garantizar la integridad de los datos, dar soporte a tiempos de respuesta más cortos y cumplir los requisitos normativos a medida que ampliaba sus servicios de análisis y fabricación de oligonucleótidos.


Soluciones


Los sistemas LC y LC-MS de Waters ofrecen un rendimiento de separaciones y una sensibilidad líderes para el análisis de oligonucleótidos sintéticos.

Los sistemas LC y LC-MS de Waters ofrecen un rendimiento de separaciones y una sensibilidad líderes para el análisis de oligonucleótidos sintéticos.

Adsorción no específica ultrabaja para una sensibilidad y una reproducibilidad máximas

Adsorción no específica ultrabaja para una sensibilidad y una reproducibilidad máximas

Los sistemas y columnas MaxPeak Premier eliminan la imprevisibilidad de las pérdidas de analitos debidas a interacciones con metales, que pueden ser especialmente pronunciadas con los oligonucleótidos cargados negativamente.

  • Characterization
  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis

Una solución de LC-MS lista para el cumplimiento regulatorio creada para facilitar el uso y la implementación en los laboratorios de desarrollo y fabricación

Una solución de LC-MS lista para el cumplimiento regulatorio creada para facilitar el uso y la implementación en los laboratorios de desarrollo y fabricación

Simplifique el análisis de oligonucleótidos de LC-MS de alto rendimiento para todos los niveles de experiencia con la solución LC-MS BioAccord de Waters, que integra un LC ACQUITY Premier con un detector de MS de alta resolución ACQUITY RDa y se ejecuta en la plataforma waters_connect, lista para el cumplimiento normativo.

  • Characterization
  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis

Cobertura robusta de alta resolución para una caracterización confiable

Cobertura robusta de alta resolución para una caracterización confiable

Acelere la caracterización de oligonucleótidos sintéticos con el sistema de sobremesa HRMS de alto rendimiento Xevo G3 QTof, que proporciona resultados cualitativos y cuantitativos exactos.

  • Characterization
  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis

Sensibilidad exquisita para los análisis de cuantificación

Sensibilidad exquisita para los análisis de cuantificación

Amplíe el alcance del análisis de sensibilidad más avanzado con el nuevo espectrómetro de masas de triple cuadrupolo Xevo TQ Absolute XR de Waters, que ofrece niveles sin precedentes de sensibilidad y robustez para las aplicaciones bioanalíticas de oligonucleótidos.

  • Quantitative Analysis

Rendimiento excepcional para la caracterización de oligonucleótidos y análisis de impurezas

Rendimiento excepcional para la caracterización de oligonucleótidos y análisis de impurezas

El espectrómetro de masas Xevo MRT, altamente avanzado, ofrece una exactitud de masa de ppm bajas a sub-ppm, así como altos niveles de sensibilidad y rango dinámico para la caracterización exhaustiva de oligonucleótidos. Esto incluye la detección confiable de varias impurezas sintéticas relacionadas con el producto y la detección de diferencias o modificaciones sutiles.

  • Characterization
  • Impurities Analysis

Analizar anticuerpos oligo-conjugados (AOC) en su estado nativo

Analizar anticuerpos oligo-conjugados (AOC) en su estado nativo

Los métodos LC-MALS permiten el análisis de rutina de AOC, incluida la determinación del promedio de los ratios de oligonucleótidos a anticuerpos (OAR) y las especies de alto peso molecular (HMWS)/agregación en todas las fases móviles acuosas, incluidos los tampones de formulación.

  • Characterization
  • Impurities Analysis

Eleve el rendimiento de la purificación analítica al siguiente nivel

Eleve el rendimiento de la purificación analítica al siguiente nivel

El sistema de purificación a escala analítica es una solución de purificación totalmente automatizada diseñada para laboratorios de purificación que requieren purificación más eficiente en escalas más pequeñas. Ofrece opciones de procesamiento de muestras de alta capacidad, recolección de fracciones de volumen bajo y capacidades de alta presión.

  • Characterization
  • Impurities Analysis

El software de Waters agiliza la adquisición, el procesamiento y la generación de informes de datos de los resultados del análisis de oligonucleótidos.

El software de Waters agiliza la adquisición, el procesamiento y la generación de informes de datos de los resultados del análisis de oligonucleótidos.

Simplifique el procesamiento y el análisis de datos

Simplifique el procesamiento y el análisis de datos

Acelere el proceso desde el análisis de muestras hasta la toma de decisiones con waters_connect para el análisis biofarmacéutico. Esta plataforma de adquisición de datos, análisis y generación de informes, lista para el cumplimiento normativo y con conexión de red, admite la implementación de métodos de LC-MS en los laboratorios de desarrollo y fabricación. Además, ofrece aplicaciones integradas para el análisis de masa intacta, la confirmación de secuencias de oligonucleótidos y ARNm, la monitorización de procesos y el análisis cuantitativo, entre otros.

  • Impurities Analysis
  • Purification
  • Characterization

Haga coincidir los picos de los espectros de MS con las bibliotecas de CDS de Empower

Haga coincidir los picos de los espectros de MS con las bibliotecas de CDS de Empower

Los usuarios pueden crear bibliotecas de espectros de MS en Empower CDS para hacer coincidir los picos de espectros de las muestras recogidas en diferentes proyectos y en diferentes condiciones. Las opciones de filtrado aumentan la exactitud de la coincidencia espectral.

  • Impurities Analysis
  • Purification

Columnas de oligonucleótidos, patrones y herramientas de preparación de muestras diseñadas específicamente para ofrecer el máximo rendimiento y productividad.

Columnas de oligonucleótidos, patrones y herramientas de preparación de muestras diseñadas específicamente para ofrecer el máximo rendimiento y productividad.

Sensibilidad mejorada con una estabilidad inigualable del pH y la temperatura

Sensibilidad mejorada con una estabilidad inigualable del pH y la temperatura

Estas columnas constan de partículas de sílice, que proporcionan una tolerancia inigualable al pH y a la temperatura, y la tecnología de superficie MaxPeak Premier, que ofrece una adsorción no específica ultrabaja. Gracias a ello, proporcionan una resolución, sensibilidad y estabilidad excepcionales del par iónico en fase reversa (IP-RP) para el análisis de oligonucleótidos. Cada lote de sorbente se somete a pruebas de QC con el patrón de oligonucleótidos MassPREP de Waters para garantizar una excelente reproducibilidad entre lotes.

  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis
  • Characterization

Extracciones de alta recuperación para bioanálisis por LC-MS

Extracciones de alta recuperación para bioanálisis por LC-MS

Los kits de SPE OligoWorks ofrecen altas recuperaciones a través de un flujo de trabajo fácil de automatizar, compatible con la MS y sin detergentes. Esto permite ahorrar tiempo, reducir el desarrollo de métodos y mejorar la eficacia del laboratorio con un rendimiento confiable probado por QC.

  • Quantitative Analysis

Evalúe el rendimiento de las columnas y del sistema con confianza

Evalúe el rendimiento de las columnas y del sistema con confianza

Elimine la necesidad de preparar mezclas complejas con los patrones de oligonucleótidos con lote certificado y en paquete de Waters, que ofrecen facilidad de uso y tranquilidad a la hora de realizar separaciones de oligonucleótidos.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Logre una formación de aductos ultrabaja para una mayor sensibilidad de MS

Logre una formación de aductos ultrabaja para una mayor sensibilidad de MS

Logre una formación de aductos de sodio y potasio ultrabaja con IonHance HFIP de calidad MS de Waters: un reactivo de alta pureza compatible con LC-MS que ofrece el rendimiento y la confianza necesarios para el análisis IP-RP LC-MS de oligonucleótidos. Ahora disponible en envases de 10 y 100 ml.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization
  • Bioanálisis

Selectividad ortogonal con cromatografía sin emparejamiento iónico

Selectividad ortogonal con cromatografía sin emparejamiento iónico

La cromatografía de interacción hidrofílica (HILIC) ofrece selectividad ortogonal y una opción de LC sin emparejamiento iónico para el análisis de oligonucleótidos.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Logre fracciones de más pureza y mayores rendimientos

Logre fracciones de más pureza y mayores rendimientos

Las columnas preparativas de oligonucleótidos de Waters admiten el aumento de escala directo desde columnas de escala analítica, así como purificaciones de alto rendimiento con alta recuperación. Cada lote de sorbente se somete a pruebas de QC y se selecciona utilizando patrones de oligonucleótidos de Waters para garantizar un rendimiento reproducible y una buena reproducibilidad. Para una máxima flexibilidad, las columnas están disponibles en MaxPeak Premier y hardware de acero inoxidable.

  • Impurities Analysis
  • Purification

Gane en eficiencia y reduzca el tiempo de espera con las soluciones de automatización de laboratorio verificadas

Gane en eficiencia y reduzca el tiempo de espera con las soluciones de automatización de laboratorio verificadas

Mejore la eficiencia y el rendimiento de la preparación de muestras

Mejore la eficiencia y el rendimiento de la preparación de muestras

Agilice la extracción de oligonucleótidos de biofluidos para análisis cuantitativo de LC-MS con flujos de trabajo verificados que ayuden a minimizar la variabilidad, mejorar la trazabilidad y simplificar la transferencia de métodos.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Está a solo un clic de conseguir el éxito

Está a solo un clic de conseguir el éxito

Optimice la productividad y el éxito de su laboratorio con Waters Global Services. Mantenga el máximo rendimiento del sistema, reduzca al máximo el tiempo de inactividad, supere los retos de aplicaciones y cumpla con los estrictos requisitos de cumplimiento normativo.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Haga que la ciencia sea más accesible con Waters Capital

Haga que la ciencia sea más accesible con Waters Capital

Maximice los recursos y minimice el riesgo con las opciones de pago de Waters Capital, que incluyen la actualización de equipos obsoletos, la obtención de soporte personalizado y la combinación de servicios en un único pago mensual.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Los datos hablan por sí solos

Los datos hablan por sí solos

Evalúe el carácter inerte del sistema ACQUITY Premier UPLC y la columna ACQUITY Premier OST utilizando el oligómero de 21 nt: Comparación del cromatograma UV de la concentración más baja detectable (0,5 nM o 5 femtomoles del oligonucleótido de 21 iones cargado en la columna) con la anterior inyección de blanco.

Curvas de calibración de GEM91 utilizando una columna de acero inoxidable y un sistema convencional (rojo), una columna ACQUITY Premier y un sistema convencional (azul) y una columna y sistema ACQUITY Premier (violeta). Las diferentes pendientes indican diferencias claras en la recuperación utilizando las columnas y los sistemas probados.

Cromatogramas TUV y TIC que muestran el rendimiento del sistema BioAccord cuando el patrón OST 1 μM se diluyó 100 veces (carga de muestra de 100 fmoles). Los cinco oligonucleótidos principales se detectan claramente en los cromatogramas de UV y TIC, lo que indica que el sistema de LC-MS y el método tienen la sensibilidad adecuada para detectar impurezas de oligonucleótidos de bajo nivel.

Se logró la confirmación de la secuencia en escalera completa de LC-MS/MS para la secuencia de ssRNA de 5’-UCGUCAAGCGAUUACAAGGTT-3’. El experimento se llevó a cabo utilizando el pico M4- como ion precursor. Las asignaciones de los picos de fragmentación se han realizado comparándolas con las masas teóricas mediante cálculos sencillos en archivos de Excel. MaxEnt3 se utilizó para la deconvolución y la eliminación de isótopos de la carga.


Seminarios web y recursos



  • Folleto

Folleto de cuantificación de oligonucleótidos

Folleto de cuantificación de oligonucleótidos
  • eBook

Libro electrónico de caracterización de oligonucleótidos

Libro electrónico de caracterización de oligonucleótidos
  • eBook

Libro electrónico de purificación de oligonucleótidos

Libro electrónico de purificación de oligonucleótidos
  • Folleto

Folleto Soluciones de análisis de oligonucleótidos: Decisiones optimizadas para una calidad consistente

Folleto Soluciones de análisis de oligonucleótidos: Decisiones optimizadas para una calidad consistente
  • Cuaderno de aplicaciones

Cuaderno de aplicaciones de oligonucleótidos

Cuaderno de aplicaciones de oligonucleótidos
  • Póster

Añadir la detección de masas rentable para mejorar la productividad en los ensayos de screening de oligonucleótidos

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  • Infografía

Simplifique el bioanálisis de oligoterapias

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  • Seminario web a demanda

El arte de la purificación de ARN: estrategias para mejorar la escalabilidad y el rendimiento de oligonucleótidos largos y modificados

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Waters ofrece una catálogo completo de sistemas de cromatografía líquida, instrumentos, espectrómetros de masas y soluciones analíticas para la investigación de ácidos nucleicos de variedades de cadena larga (ARNm, ADN de cadena simple y ADN de cadena doble).

Proporcione una resolución de muestra excepcional y una vida útil superior de la columna con las columnas para oligonucleótidos de Waters para separaciones de oligonucleótidos de ADN/ARN. Cada columna se somete a pruebas de control de calidad (QC) para garantizar el rendimiento entre lotes.

Disfrute del procesamiento de muestras de alta capacidad y la recolección de fracciones a escalas cromatográficas preparativas más pequeñas con una solución de purificación más eficiente y rentable: el sistema de purificación a escala analítica.

Obtener más información sobre las soluciones de oligonucleótidos sintéticos.

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