Analyse des oligonucléotides de synthèse

Analyse des oligonucléotides de synthèse

De la préparation des échantillons à la séparation chromatographique, en passant par la détection optique et de masse, ainsi que par l’analyse des données conforme et la création de rapports, les outils de Waters adaptés à l’analyse des oligonucléotides offrent des performances et une productivité optimales. Les outils sont soutenus par nos équipes de Services Clients et d’assistance afin d’accélérer vos efforts de développement thérapeutique, diagnostique et de recherche.

De la préparation des échantillons à la séparation chromatographique, en passant par la détection optique et de masse, ainsi que par l’analyse des données conforme et la création de rapports, les outils de Waters adaptés à l’analyse des oligonucléotides offrent des performances et une productivité optimales. Les outils sont soutenus par nos équipes de Services Clients et d’assistance afin d’accélérer vos efforts de développement thérapeutique, diagnostique et de recherche.


Aperçu

La reprise du développement thérapeutique des oligonucléotides a conduit à une expansion rapide du pipeline préclinique/clinique. Agissant au niveau de la transcription et de la traduction des gènes, ces médicaments à base d’acides nucléiques à chaînes courtes sont très prometteurs pour de nombreux troubles héréditaires et maladies courantes.

Depuis plus d’une décennies, Waters est à l’origine du développement d’outils et de techniques avancées pour la caractérisation, la purification et la bioanalyse des oligonucléotides synthétiques. Avec passion, dévouement et détermination, nous souhaitons aider nos clients à résoudre les défis analytiques les plus difficiles. De nos colonnes de chromatographie haute performance innovante et des produits consommables pour la préparation des échantillons à notre suite d’instruments de chromatographie liquide, de spectrométrie de masse et de diffusion de lumière, en passant par nos logiciels de conformité et nos workflows basés sur les applications, ainsi que notre service et support sans précédent, nous sommes prêts à vous aider à atteindre vos objectifs de développement d’oligonucléotides de synthèse.


Applications

Dans le cas des thérapies à base d’oligonucléotides, la séquence et l’emplacement des nucléotides modifiés sont d’une importance essentielle pour leur fonction, leur stabilité et leur efficacité. La fragmentation LC/MS/MS est une technique clé qui permet d’obtenir ce niveau de confirmation des séquences et des outils automatisés d’analyse des données et de création de rapports facilitent le processus.

Dans le cas des thérapies à base d’oligonucléotides, la séquence et l’emplacement des nucléotides modifiés sont d’une importance essentielle pour leur fonction, leur stabilité et leur efficacité. La fragmentation LC/MS/MS est une technique clé qui permet d’obtenir ce niveau de confirmation des séquences et des outils automatisés d’analyse des données et de création de rapports facilitent le processus.


Notes d’application

Notes d’application

Les oligonucléotides synthétiques contiennent de nombreuses impuretés liées au procédé et au produit, y compris des séquences d'échec n-X tronquées, des variants oxydés (par exemple, des conversions PS à PO) et désaminés. De plus, pour les espèces d'ARN double brin (par exemple, des siRNA), des composants simple brin sont également considérés comme des impuretés. Pour les fichiers réglementaires, ces impuretés doivent être identifiées et quantifiées jusqu'à 0,01 % de la longueur totale du produit.

Les oligonucléotides synthétiques contiennent de nombreuses impuretés liées au procédé et au produit, y compris des séquences d'échec n-X tronquées, des variants oxydés (par exemple, des conversions PS à PO) et désaminés. De plus, pour les espèces d'ARN double brin (par exemple, des siRNA), des composants simple brin sont également considérés comme des impuretés. Pour les fichiers réglementaires, ces impuretés doivent être identifiées et quantifiées jusqu'à 0,01 % de la longueur totale du produit.


Notes d’application

Notes d’application

L’analyse quantitative des oligonucléotides à partir de biofluides nécessite des approches efficaces de préparation des échantillons afin d’obtenir un rendement maximal, une reproductibilité et des limites de détection inférieures. Les outils de préparation des échantillons, de chromatographie en phase liquide et de spectrométrie de masse de Waters sont conçus pour fournir la sensibilité, la reproductibilité et la productivité nécessaires à vos projets de bioanalyse d’oligonucléotides.

L’analyse quantitative des oligonucléotides à partir de biofluides nécessite des approches efficaces de préparation des échantillons afin d’obtenir un rendement maximal, une reproductibilité et des limites de détection inférieures. Les outils de préparation des échantillons, de chromatographie en phase liquide et de spectrométrie de masse de Waters sont conçus pour fournir la sensibilité, la reproductibilité et la productivité nécessaires à vos projets de bioanalyse d’oligonucléotides.


Notes d’application

Notes d’application

Les particules imperceptibles et visibles présentes dans les oligonucléotides de synthèse peuvent compromettre la sécurité des patients et entraîner des rappels couteux par la FDA. L’imagerie en arrière-plan sur membrane (BMI) et la microscopie à fluorescence sur membrane (FMM) vous permettent de compter et d’identifier les particules à haute vitesse d’analyse avec un minimum de 5 µL d’échantillon, ce qui vous aide à atténuer les risques dès le début de la procédure, à assurer la conformité et à prendre des décisions en toute confiance.

Les particules imperceptibles et visibles présentes dans les oligonucléotides de synthèse peuvent compromettre la sécurité des patients et entraîner des rappels couteux par la FDA. L’imagerie en arrière-plan sur membrane (BMI) et la microscopie à fluorescence sur membrane (FMM) vous permettent de compter et d’identifier les particules à haute vitesse d’analyse avec un minimum de 5 µL d’échantillon, ce qui vous aide à atténuer les risques dès le début de la procédure, à assurer la conformité et à prendre des décisions en toute confiance.


Notes d’application

Notes d’application

Découvrir comment les colonnes préparatives d’oligonucléotides à l’échelle de laboratoire et les consommables de Waters permettent une mise à l’échelle directe, un rendement élevé et des purifications à haute cadence d’analyse. Doté d’une stabilité au pH et à la température inégalée dans le secteur, chaque lot de sorbant est soumis à un contrôle qualité et sélectionné à l’aide d’étalons d’oligonucléotides fabriqués par Waters, afin de garantir la performance et la reproductibilité interlots.

Découvrir comment les colonnes préparatives d’oligonucléotides à l’échelle de laboratoire et les consommables de Waters permettent une mise à l’échelle directe, un rendement élevé et des purifications à haute cadence d’analyse. Doté d’une stabilité au pH et à la température inégalée dans le secteur, chaque lot de sorbant est soumis à un contrôle qualité et sélectionné à l’aide d’étalons d’oligonucléotides fabriqués par Waters, afin de garantir la performance et la reproductibilité interlots.


Notes d’application

Notes d’application


Étude de cas : BioSpring implémente les flux de travail LC/MS de Waters pour les oligonucléotides afin d’étendre la gamme existante

Découvrez comment BioSpring a utilisé le système conforme LC/MS BioAccord de Waters et le système Vion IMS Q-Tof avec water_connect afin de garantir l’intégrité des données, de prendre en charge des délais de traitement plus courts et de répondre aux exigences réglementaires dans le cadre de l’expansion de ses services de fabrication et d’analyse d’oligonucléotides.

Découvrez comment BioSpring a utilisé le système conforme LC/MS BioAccord de Waters et le système Vion IMS Q-Tof avec water_connect afin de garantir l’intégrité des données, de prendre en charge des délais de traitement plus courts et de répondre aux exigences réglementaires dans le cadre de l’expansion de ses services de fabrication et d’analyse d’oligonucléotides.


Solutions


Les systèmes LC et LC/MS de Waters offrent des performances de séparation et une sensibilité de pointe pour l’analyse des oligonucléotides de synthèse.

Les systèmes LC et LC/MS de Waters offrent des performances de séparation et une sensibilité de pointe pour l’analyse des oligonucléotides de synthèse.

Adsorption non spécifique ultra-faible pour une sensibilité et une reproductibilité maximales

Adsorption non spécifique ultra-faible pour une sensibilité et une reproductibilité maximales

Les colonnes et les systèmes MaxPeak Premier éliminent le caractère imprévisible des pertes d’analytes en raison d’interactions métalliques, qui peuvent être particulièrement accentuées sur des oligonucléotides à charge négative.

  • Characterization
  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis

Une solution LC/MS conforme, conçue pour faciliter l’utilisation et le déploiement dans les laboratoires de développement et de fabrication

Une solution LC/MS conforme, conçue pour faciliter l’utilisation et le déploiement dans les laboratoires de développement et de fabrication

Simplifiez l’analyse des oligonucléotides par LC/MS haute performance pour tous les niveaux d’expertise avec la solution LC/MS BioAccord de Waters, qui intègre un système LC ACQUITY Premier avec un détecteur de spectrométrie de masse haute résolution ACQUITY RDa, et s’exécute sur waters_connect Platform connecté.

  • Characterization
  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis

Couverture haute résolution robuste pour une caractérisation fiable

Couverture haute résolution robuste pour une caractérisation fiable

Accélérez la caractérisation des oligonucléotides de synthèse avec le système de banc d’essai HRMS haute performance du spectromètre de masse Xevo G3 Q-Tof qui fournit des résultats qualitatifs et quantitatifs précis.

  • Characterization
  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis

Sensibilité excellente pour les analyses de quantification

Sensibilité excellente pour les analyses de quantification

Élargissez le champ d’application de l’analyse de sensibilité optimale avec le spectromère de masse triple quadripolaire Xevo TQ Absolute XR de Waters, qui offre des niveaux inégalés de sensibilité et de robustesse pour vos applications bioanalytiques d’oligonucléotides.

  • Quantitative Analysis

Performances exceptionnelles pour la caractérisation des oligonucléotides et l’analyse des impuretés

Performances exceptionnelles pour la caractérisation des oligonucléotides et l’analyse des impuretés

Le spectromètre de masse Xevo MRT, très puissant, offre une précision de masse de l’ordre du ppm et en deça, associée à des niveaux élevés de sensibilité et de gamme dynamique pour la caractérisation en profondeur des oligonucléotides, et permet notamment de détecter de plusieurs impuretés synthétiques liées aux produits et de détecter des différences et modifications infimes.

  • Characterization
  • Impurities Analysis

Analysez les conjugués oligonucléotides-anticorps (AOC) à l’état natif

Analysez les conjugués oligonucléotides-anticorps (AOC) à l’état natif

Les méthodes LC/MALS permettent d’analyser en routine les AOC, notamment de déterminer les rapports moyen entre oligonucléotides et anticorps, et l’agrégation ou les espèces de masse moléculaire élevée dans toutes les phases mobiles aqueuses, y compris les tampons de formulation.

  • Characterization
  • Impurities Analysis

Élevez vos performances de purification analytique au niveau supérieur

Élevez vos performances de purification analytique au niveau supérieur

Le système de purification à petite échelle est une solution de purification entièrement automatique, conçue pour les laboratoires de purification nécessitant une purification plus efficace avec des échelles plus faibles. Il permet un traitement d’échantillons à capacité élevée, une collecte de fractions de faible volume, ainsi qu’un fonctionnement à haute pression.

  • Characterization
  • Impurities Analysis

Le logiciel Waters simplifie l’acquisition et le traitement des données, ainsi que la communication des résultats d’analyse d’oligonucléotides.

Le logiciel Waters simplifie l’acquisition et le traitement des données, ainsi que la communication des résultats d’analyse d’oligonucléotides.

Analyse et traitement des données simplifiés

Analyse et traitement des données simplifiés

Accélérez le trajet de l’analyse d’échantillons à la prise de décision grâce à waters_connect pour l’analyse biopharmaceutique. Cette plateforme d'acquisition des données, d'analyse et de création de rapports, répondant aux exigences réglementaires et connectable en réseau, prend en charge le déploiement de méthodes LC/MS dans les laboratoires de développement et de fabrication, et propose des applications intégrées pour l'analyse de masse intacte, la confirmation de séquences d'oligonucléotides et d'ARNm, la surveillance des procédés, l'analyse quantitative, etc.

  • Impurities Analysis
  • Purification
  • Characterization

Mise en correspondance des pics spectraux MS avec les bibliothèques CDS Empower

Mise en correspondance des pics spectraux MS avec les bibliothèques CDS Empower

Les utilisateurs peuvent créer des bibliothèques de spectres MS dans le logiciel Empower CDS, afin de mettre en correspondance les pics spectraux issus des échantillons recueillis dans des conditions et des projets divers. Les options de filtrage améliorent l’exactitude de la correspondance spectrale.

  • Impurities Analysis
  • Purification

Colonnes d’oligonucléotides, étalons et outils de préparation des échantillons spécialement conçus pour des performances et une productivité maximales.

Colonnes d’oligonucléotides, étalons et outils de préparation des échantillons spécialement conçus pour des performances et une productivité maximales.

Sensibilité améliorée avec une stabilité au pH et à la température inégalée

Sensibilité améliorée avec une stabilité au pH et à la température inégalée

Constituées de particules de silice offrant une tolérance inégalée au pH et à la température, et de la technologie de surface MaxPeak Premier permettant une adsorption non spécifique ultra-faible, ces colonnes offrent une résolution, une sensibilité et une stabilité exceptionnelles en phase inverse avec appariement d’ions (IP-RP) pour l’analyse d’oligonucléotides. Chaque lot de sorbant est soumis à des tests de contrôle qualité avec notre étalon d’oligonucléotides MassPREP de Waters pour garantir une excellente reproductibilité d’un lot à l’autre.

  • Impurities Analysis
  • Quantitative Analysis
  • Characterization

Extractions à rendement élevé pour la bioanalyse LC/MS

Extractions à rendement élevé pour la bioanalyse LC/MS

Les kits SPE OligoWorks offrent des rendements élevés grâce à un workflow sans détergent, compatible avec la spectrométrie de masse et adapté à l'automatisation. Ils permettent de gagner du temps, de réduire le développement de méthodes et d’améliorer l’efficacité du laboratoire grâce à des performances fiables et soumises à des tests de contrôle qualité.

  • Quantitative Analysis

Analyse comparative des performances de la colonne et du système en toute confiance

Analyse comparative des performances de la colonne et du système en toute confiance

Éliminez le besoin de préparer des mélanges complexes grâce aux étalons d’oligonucléotides préemballés et certifiés de Waters, qui offrent une facilité d’utilisation et une tranquillité d’esprit lors d’opérations de séparation d’oligonucléotides.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Obtenez une formation d’adduits ultra-faibles pour une sensibilité MS accrue

Obtenez une formation d’adduits ultra-faibles pour une sensibilité MS accrue

Obtenez une formation d’adduits de sodium et de potassium à des concentrations ultra-faibles avec le HFIP IonHance de qualité spectrométrique de masse de Waters : un réactif de pureté élevée, compatible LC/MS, offrant les performances et la fiabilité nécessaires à l’analyse LC/MS en phase inverse avec appariement d’ions des oligonucléotides. Désormais disponible en 10 et 100 mL.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization
  • Bioanalyse

Sélectivité orthogonale avec chromatographie sans appariement d’ions

Sélectivité orthogonale avec chromatographie sans appariement d’ions

La chromatographie par interaction hydrophile (HILIC) offre une sélectivité orthogonale et une option LC sans appariement d’ions pour l’analyse des oligonucléotides.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Obtenez des fractions de plus grande pureté avec des rendements plus élevés

Obtenez des fractions de plus grande pureté avec des rendements plus élevés

Les colonnes préparatives d’oligonucléotides de Waters prennent en charge la mise à l’échelle directe à partir de colonnes analytiques et permettent d’effectuer des purifications à haute cadence avec un rendement élevé. Chaque lot de sorbant est testé à des fins de contrôle qualité, puis sélectionné à l’aide des étalons d’oligonucléotides de Waters afin de garantir des performances et une reproductibilité constantes. Pour une flexibilité maximale, les colonnes sont disponibles en version MaxPeak Premier et en acier inoxydable.

  • Impurities Analysis
  • Purification

Gagnez en efficacité et en temps grâce à des solutions d’automatisation de laboratoire vérifiées.

Gagnez en efficacité et en temps grâce à des solutions d’automatisation de laboratoire vérifiées.

Amélioration de l’efficacité et du rendement de la préparation des échantillons

Amélioration de l’efficacité et du rendement de la préparation des échantillons

Simplifiez l’extraction d’oligonucléotides des biofluides pour les analyses LC/MS quantitatives grâce aux flux de travail vérifiés qui permettent de minimiser la variabilité, d’améliorer la traçabilité et de simplifier le transfert de méthode.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Votre réussite à portée d’un clic

Votre réussite à portée d’un clic

Optimisez la productivité et la réussite de votre laboratoire avec les Services Clients de Waters. Maintenez les performances de pointe de votre système, réduisez les temps d’immobilisation, répondez à vos défis applicatifs et respectez les exigences de conformité les plus strictes.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Rendez la science plus accessible grâce à Waters Capital

Rendez la science plus accessible grâce à Waters Capital

Maximisez les ressources et minimisez les risques grâce aux options de paiement proposées par Waters Capital, notamment la mise à niveau des équipements vieillissants, une assistance personnalisée et le regroupement de l’ensemble de vos services en un seul forfait mensuel.

  • Quantitative Analysis
  • Impurities Analysis
  • Characterization

Les données parlent d’elles-mêmes

Les données parlent d’elles-mêmes

Test de l’inertie du système UPLC ACQUITY Premier et de la colonne OST ACQUITY Premier à l’aide de l’oligomère 21-nt : chromatogramme UV de la concentration la plus faible détectable (0,5 nM ou 5 femtomoles de l’oligonucléotide 21-mers chargé sur colonne) comparée à l’injection de blanc précédente.

Courbes d’étalonnage du modulateur d’expression génique GEM91 utilisant une colonne en acier inoxydable et un système classique (rouge), une colonne ACQUITY Premier et un système classique (bleu), ainsi qu’une colonne et un système ACQUITY Premier (violet). Les différentes tendances indiquent des différences marquées dans la récupération à l’aide des colonnes et des systèmes testés.

Chromatogrammes TUV et TIC illustrant les performances du système BioAccord lorsque l’étalon OST de 1 μM a été dilué 100 fois (chargement d’un échantillon de 100 fmoles). Les cinq oligonucléotides principaux sont clairement détectés dans les chromatogrammes UV et TIC, ce qui indique que la sensibilité du système et de la méthode LC/MS est appropriée pour détecter les impuretés d’oligonucléotides de faible niveau.

La séquence de l’échelle complète LC/MS/MS a été confirmée pour la séquence de l’ARN simple brin de 5’-UCGUCAAGCGAUUACAAGGTT-3’. L’expérience a été réalisée à l’aide du pic M4 comme ion précurseur. L’attribution des pics de fragmentation a été réalisée en comparant les masses théoriques à l’aide de simples calculs dans un fichier Excel. MaxEnt3 a été utilisé pour la déconvolution des charges et le désisotopage.


Webinaires et ressources



  • Brochure

Quantification des oligonucléotides – Brochure

Quantification des oligonucléotides – Brochure
  • eBook

eBook sur la caractérisation des oligonucléotides

eBook sur la caractérisation des oligonucléotides
  • eBook

eBook sur la purification des oligonucléotides

eBook sur la purification des oligonucléotides
  • Brochure

Dépliant « Solutions d’analyse des oligonucléotides : des décisions simplifiées pour une qualité constante »

Dépliant « Solutions d’analyse des oligonucléotides : des décisions simplifiées pour une qualité constante »
  • Guide d’applications

Guide d’applications destinées aux oligonucléotides

Guide d’applications destinées aux oligonucléotides
  • Poster

Ajout d’une détection de masse rentable pour améliorer la productivité des essais de criblage des oligonucléotides

Ajout d’une détection de masse rentable pour améliorer la productivité des essais de criblage des oligonucléotides
  • Infographie

Simplifiez la bioanalyse des oligonucléotides thérapeutiques

Simplifiez la bioanalyse des oligonucléotides thérapeutiques
  • Webinaire à la demande

L’art de la purification de l’ARN : considérations méthodologiques pour améliorer l’évolutivité et le rendement avec les oligonucléotides modifiés longs

L’art de la purification de l’ARN : considérations méthodologiques pour améliorer l’évolutivité et le rendement avec les oligonucléotides modifiés longs

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Analysez efficacement les vecteurs viraux grâce aux solutions dédiées de Waters, qui comprennent des instruments de chromatographie liquide et de spectrométrie de masse conçus pour garantir l’innocuité et l’efficacité des médicaments.

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Appréciez le traitement d’échantillons et la collecte de fractions à capacité élevée, à des échelles de chromatographie préparative plus faibles, grâce à une solution de purification plus efficace et économique : le système de purification à petite échelle.

Découvrez-en davantage sur les solutions pour les oligonucléotides de synthèse.

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