Scambio Idrogeno-Deuterio - Spettrometria di Massa

Scambio Idrogeno-Deuterio - Spettrometria di Massa

Trasforma le procedure HDX manuali in una soluzione automatizzata di facile utilizzo con Waters. Scopri in che modo i recenti progressi nelle tecnologie LC-MS, nell’automazione e nell’informatica hanno trasformato HDX-MS in uno strumento robusto per gli studi sulla struttura delle proteine.

Trasforma le procedure HDX manuali in una soluzione automatizzata di facile utilizzo con Waters. Scopri in che modo i recenti progressi nelle tecnologie LC-MS, nell’automazione e nell’informatica hanno trasformato HDX-MS in uno strumento robusto per gli studi sulla struttura delle proteine.

Struttura proteica 3D
Protein structure 3D

Panoramica

In collaborazione con Trajan, Waters ha trasformato un processo analitico altamente manuale in un sistema integrato e automatizzato con il nostro sistema HDX-MS, che sfrutta le separazioni UPLC ad alta pressione su scala nanometrica e micrometrica, la robotica di manipolazione dei campioni e la spettrometria di massa ad alta risoluzione con mobilità ionica per l’analisi approfondita negli studi strutturali delle proteine, tra cui:

  • Mappatura degli epitopi 
  • Legame proteina-principio attivo 
  • Interazioni proteina-proteina 
  • Aggregazione 
  • Effetti della mutazione sulla conformazione e sulla dinamica delle proteine 
  • Modifiche conformazionali dovute alle formulazioni e ai test di stabilità 

Il sistema completo Waters per studi HDX-MS disponibile in commercio abbina il nostro sistema ACQUITY UPLC M-Class con tecnologia HDX a uno spettrometro di massa Waters come il sistema SELECT SERIES Cyclic IMS, alla robotica Trajan e al software specifico per applicazioni HDX DynamX.



Principi di scambio di idrogeno-deuterio

Principi di scambio di idrogeno-deuterio

La MS a scambio idrogeno-deuterio (HDX) serve per molte applicazioni, tra cui la comprensione del modo in cui i farmaci a piccole molecole si legano ai bersagli proteici e l’esecuzione della mappatura degli epitopi. Con questa tecnologia, la MS misura le variazioni quando il deuterio in una soluzione sostituisce l’idrogeno ammidico nella struttura portante di una biomolecola.

Sulla struttura portante di una biomolecola, lo scambio tra l’idrogeno ammidico e il deuterio in soluzione avviene a velocità diverse, in parte a seconda della conformazione. La MS è in grado di misurare queste variazioni e quindi dedurre il grado di attività in vari siti. Queste posizioni possono essere identificate e mappate sulla sequenza primaria, il che consente una visualizzazione più semplice e rivela informazioni sulla struttura delle proteine. Il folding relativo e la dinamica possono essere determinati in base alle diverse velocità di assorbimento in posizioni diverse.

Generazione di set di dati completi per tutti i peptidi

Generazione di set di dati completi per tutti i peptidi

Con UPLC-MSE, il laboratorio può generare un set di dati completo, misurando tutti i peptidi senza distorsione in base all'intensità del loro segnale. Questa è una caratteristica importante per gli studi HDX, in cui le informazioni chiave potrebbero trovarsi nei peptidi a bassa intensità.

HDX-MS rivela nuove informazioni sulla dinamica delle biomolecole, fornendo dettagli sull’assorbimento relativo del deuterio in diverse conformazioni di una proteina o in diverse posizioni all’interno della proteina stessa. I recenti sviluppi hanno reso la tecnologia HDX con spettrometria di massa uno strumento più accessibile per studiare le dinamiche della struttura di ordine superiore (HOS) dei farmaci bioterapeutici. Le tendenze del settore e delle normative hanno chiaramente spostato il focus sulla conformazione e sulle relazioni tra le biomolecole, facendo di HDX uno strumento chiave che viene rapidamente adottato in aree di analisi di ambito bioterapeutico.


Caratterizzazione dei Biosimilari

Scopri come le tecnologie Waters LC-MS possono aiutare gli sviluppatori di biosimilari a comprendere appieno la struttura e la variazione del prodotto innovatore per stabilire le specifiche dei loro biosimilari.

Scopri come le tecnologie Waters LC-MS possono aiutare gli sviluppatori di biosimilari a comprendere appieno la struttura e la variazione del prodotto innovatore per stabilire le specifiche dei loro biosimilari.


Proteina MAP chinasi p38, struttura chimica

Soluzioni


Quantificazione affidabile delle modifiche nella conformazione delle proteine

Quantificazione affidabile delle modifiche nella conformazione delle proteine

Sfruttate le separazioni UPLC e la spettrometria di massa ad alta risoluzione (HRMS) per identificare con sicurezza i cambiamenti nella conformazione delle proteine grazie al sistema ACQUITY UPLC M-Class con tecnologia HDX.

  • Structural Biology

Analisi completa per una caratterizzazione sicura

Analisi completa per una caratterizzazione sicura

Massimizza le informazioni sul campione per gli analiti, dalla caratterizzazione dettagliata alla quantificazione accurata, con il sistema Xevo G3 QTof, che garantisce la massima sicurezza dei risultati.

 

  • Structural Biology

Massima potenza, massime prestazioni. Ridefinire i confini della scienza.

Massima potenza, massime prestazioni. Ridefinire i confini della scienza.

Sviluppato grazie a una collaborazione mirata, il sistema SELECT SERIES Cyclic IMS combina l’innovativa separazione con mobilità ionica ciclica alla sofisticata spettrometria di massa a tempo di volo dalle prestazioni elevate, permettendo così ai ricercatori di sbloccare il potenziale delle scoperte scientifiche.

  • Structural Biology

Le scoperte sono essenziali per prendere decisioni informate

Le scoperte sono essenziali per prendere decisioni informate

Ottieni la massima flessibilità e una maggiore libertà di scelta analitica per supportare la creatività scientifica e il successo tecnico per qualsiasi applicazione con SYNAPT XS.

  • Structural Biology

Il software Waters visualizza in modo pratico i risultati in visualizzazioni comparative e riduce i tempi di analisi grazie alle funzionalità automatizzate.

Il software Waters visualizza in modo pratico i risultati in visualizzazioni comparative e riduce i tempi di analisi grazie alle funzionalità automatizzate.

Semplificazione dell’interpretazione dello scambio idrogeno-deuterio

Semplificazione dell’interpretazione dello scambio idrogeno-deuterio

Il software per l’analisi dei dati DynamX HDX è progettato per selezionare sistematicamente gli spettri con criteri predeterminati e misurare la variazione di massa della forma deuterata. L’automazione del software è stata notevolmente semplificata grazie all’utilizzo di picchi più nitidi e alla migliore separazione, entrambi possibili con UPLC, e alla natura completa della rivelazione MSE.

  • Structural Biology

Waters offre un’ampia gamma di colonne che hanno il potenziale per superare le attuali sfide analitiche.

Waters offre un’ampia gamma di colonne che hanno il potenziale per superare le attuali sfide analitiche.

Digestione delle proteine in linea più rapida ed efficiente

Digestione delle proteine in linea più rapida ed efficiente

Ottenete una digestione proteica in linea rapida, efficiente e riproducibile con tempi di preparazione dei campioni più brevi con la colonna per pepsina enzimatica BEH.

  • Structural Biology

Standard progettati per verificare le prestazioni del sistema per le analisi di biomolecole

Standard progettati per verificare le prestazioni del sistema per le analisi di biomolecole

Ottenete risultati positivi e aggiungete un ulteriore livello di sicurezza alle applicazioni farmaceutiche e per il settore life science con gli standard Waters dedicati.

  • Structural Biology

Ottieni risultati accurati per diversi workflow di screening, conferma e quantificazione in ambito forense utilizzando i servizi analitici Waters ottimizzati.

Ottieni risultati accurati per diversi workflow di screening, conferma e quantificazione in ambito forense utilizzando i servizi analitici Waters ottimizzati.

Il vostro successo a portata di clic

Il vostro successo a portata di clic

Ottimizza la produttività del laboratorio rispettando al contempo la realtà del budget con Waters Global Services. Mantenete massimi livelli di rendimento del sistema, riducete al minimo i tempi di inattività, affrontate le sfide delle applicazioni scientifiche e agevolate il rispetto dei rigidi requisiti di conformità.

  • Structural Biology

La scienza è più accessibile con Waters Capital

La scienza è più accessibile con Waters Capital

Ottimizza le risorse di laboratorio e minimizza i rischi con le opzioni di pagamento di Waters Capital, che includono soluzioni innovative per l’aggiornamento di strumenti obsoleti, supporto personalizzato e opzioni flessibili per raggruppare la soluzione di laboratorio completa in un unico pagamento mensile: tutto ciò di cui hai bisogno per far progredire la tua scienza.

  • Structural Biology

I dati parlano da soli

I dati parlano da soli
Ritenzione del deuterio per quattro peptidi da peptidi triptici di enolasi di lievito.
Struttura cristallina di CaM codificata a colori per rappresentare l’assorbimento del deuterio. Sono state confrontate le forme (A) apo CaM e (B) holo CaM a 10 s dalla marcatura con deuterio. È stata osservata una differenza significativa nell'assorbimento del deuterio nella regione evidenziata, in cui la conformazione è stata modificata a causa del legame con il calcio.
È stato riscontrato un diverso assorbimento del deuterio dello stesso peptide in apo e holo CaM. A 10 minuti dalla marcatura, questo peptide (FKEASLF, 12-19) ha mostrato un maggiore assorbimento di deuterio in apo (riquadro a sinistra) rispetto a dolo (riquadro a destra).
Confronto della perdita di deuterio tra bradichinina e angiotensina II completamente deuterate a diversi A) temperature di digestione, B) tempi di attesa di quenching e C) velocità di flusso digestione/desalificazione. La perdita di deuterio causata dalla sorgente dello spettrometro di massa di massa è evidenziata con un bordo nero in 5B. Profili isotopici simili sono stati trovati in entrambi i peptidi a pressione normale e a pressione elevata (5D). La pressione elevata ha causato una perdita di deuterio leggermente superiore (<5%).

Applicazioni

Comprendere la relazione tra struttura e funzione delle proteine è fondamentale per interpretare i meccanismi delle patologie. La spettrometria di massa a scambio idrogeno-deuterio è diventata uno strumento indispensabile per interpretare la struttura di ordine superiore delle proteine.

Comprendere la relazione tra struttura e funzione delle proteine è fondamentale per interpretare i meccanismi delle patologie. La spettrometria di massa a scambio idrogeno-deuterio è diventata uno strumento indispensabile per interpretare la struttura di ordine superiore delle proteine.


Note Applicative

Note Applicative

Webinar e Risorse



  • Brochure

Brochure del Sistema ACQUITY UPLC M-Class con Tecnologia HDX.

Brochure del Sistema ACQUITY UPLC M-Class con Tecnologia HDX.
  • Brochure

Software per l'Analisi dei dati DynamX HDX 3.0

Software per l'Analisi dei dati DynamX HDX 3.0
  • Poster

Nuove funzionalità nel software di bioinformatica per l’elaborazione automatizzata dei dati HDX-MS

Nuove funzionalità nel software di bioinformatica per l’elaborazione automatizzata dei dati HDX-MS
  • Poster

Sistema MS a scambio idrogeno-deuterio (HDX-MS) per l'analisi delle modifiche conformazionali nella proteina calmodulina in seguito al legame del calcio

Sistema MS a scambio idrogeno-deuterio (HDX-MS) per l'analisi delle modifiche conformazionali nella proteina calmodulina in seguito al legame del calcio


Ulteriori Informazioni sulle Soluzioni di Spettrometria di Massa con Scambio Idrogeno-Deuterio.

Ulteriori Informazioni sulle Soluzioni di Spettrometria di Massa con Scambio Idrogeno-Deuterio.

Struttura proteica 3D
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