Progenesis QI
Entdecken Sie sich signifikant ändernde Verbindungen in Ihren Proben
Die Progenesis QI Software ermöglicht Ihnen genaues Quantifizieren und Identifizieren von Verbindungen in Ihren Proben, die sich signifikant ändern. Sie bietet einen äußerst intuitiven, menügeführten Workflow. Die Progenesis QI Software hilft Ihnen dabei, Herausforderungen bei der Datenanalyse zu meistern. Verbindungen von Interesse können schnell, objektiv und zuverlässig gefunden und die Ergebnisse für omics-Forschungsapplikationen exportiert werden.
Progenesis QI ist eine unabhängige Geräteplattform, die universelle Formate wie .mzML und .mzXML unterstützt. Mehr Informationen über Progenesis QI finden Sie unter www.nonlinear.com.
Progenesis QI
Überblick
- Flexibles Durchsuchen von Daten zu Verbindungen mit LipidBlast, ChemSpider, Elemental Composition, Metlin oder der Suchmethode MetaScope von Waters
- Verringern falsch-positiver IDs durch Verwendung mehrerer Suchparameter: exakte Masse, MS/MS-Fragmente, Isotopenverteilung, Retentionszeit (RT) und Stoßquerschnittsmessungen (CCS)
- Importieren von Identifizierungsergebnissen, einschließlich chemischer Strukturen aus SDF-Datenbanken und eingebetteter Weblinks zu Verbindungsdetails
- Finden Sie schnell sich signifikant ändernde Verbindungen, z. B. ANOVA, p-Wert, Fold Change (x-fache Änderung), Potenz
- Schnelles Auffinden von sich signifikant ändernden Verbindungen, z. B. Anova p-Wert, Fold-change, Potenz
- Einfache Integration von Ergebnissen mit anderen Bioinformatik-Plattformen mit umfassenden Optionen für den Datenexport
- Überprüfen und Bearbeiten der Adduktdekonvolution von Verbindungen, die zur Quantifizierung und Identifizierung einer Verbindung verwendet wird
Empfohlene Verwendung: Für das schnelle, objektive und zuverlässige Auffinden von interessierenden Verbindungen bei der LC-MS-Datenanalyse.
Features Header
Nutzen Sie komplexe Daten dank leistungsfähiger Visualisierung
Eine der wichtigsten Funktionen von Progenesis QI ist die sehr anschauliche und ansprechende Darstellung der Daten, dank derer Anwender Daten vollständig visualisieren und verstehen können. So erhalten sie noch mehr Vertrauen in die durchgeführten Messungen. Ionenintensitätskarten, die eine zweidimensionale Darstellung von chromatographischer Retentionszeit, m/z-Wert und Intensität zeigen, sowie Darstellungen von MS- und Chromatographiedaten können zur Qualitätssicherung der automatischen Vorgänge wie Abgleich, Peakauswahl und Adduktdekonvolution von Verbindungen für jede Probe genutzt werden.
Hochpräzise Quantifizierung von Verbindungen
Progenesis QI liefert exakte und präzise Messungen von Verbindungen basierend auf der Summe der Ionenintensitäten. Verbindungsaddukte werden automatisch dekonvuliert und bieten somit eine genaue Quantifizierung mit allen verfügbaren Daten. Im Anschluss an die Quantifizierung können die Verbindungen identifiziert werden, die eine statistisch signifikante Mengenänderung beim Vergleich verschiedener Gruppen aufweisen. Große Mengen an Proben aus unterschiedlichen Gruppen können analysiert werden, auch unter Anwendung unterschiedlicher Vergleichsdesigns innerhalb eines Versuchs. Das Ergebnis ist eine Liste von Verbindungen, die für die weitere Charakterisierung von Interesse sind.
Sichere Identifizierung von Verbindungen mit verschiedenen Suchparametern
Progenesis QI ermöglicht Anwendern die Identifizierung von Verbindungen nicht nur basierend auf der neutralen Masse, der Isotopenverteilung und der chromatographischen Retentionszeit, sondern auch anhand von MS/MS-Fragmentdaten und Stoßquerschnittsmessungen (CCS) mithilfe von Metascope, der neuen Suchmaschine von Waters. Die Datenbanksuche anhand mehrerer Parameter verbessert die Genauigkeit der Suche enorm und erhöht die Wahrscheinlichkeit einer korrekten Identifizierung von Verbindungen.
Leichteres Auffinden von Verbindungen von Interesse
Das Identifizieren von Verbindungen ist noch immer eine der größten Herausforderungen bei omics-Versuchen mit kleinen Molekülen. Wir bieten Ihnen Zugang zu zahlreichen Datenbanken, um Ihre Erfolgschancen beim Auffinden interessierender Verbindungen zu erhöhen. Zu den flexiblen Methoden der Verbindungssuche gehören:
- Alle Datenbanken im .SDF-Format
- Interne Datenbanken im .CSV-Format
- Metlin-Datenbank
- Datenbanken der Royal Society of Chemistry mit ChemSpider-Plugin
- LipidBlast Datenbank
- NIST MS- und MS/MS-Bibliotheken
Finden Sie Verbindungen von Interesse mithilfe von Statistiktools in Progenesis QI, darunter:
- ANOVA
- Hauptkomponentenanalyse (PCA)
- Hierarchische Clusteranalyse
Über die nahtlose Integration mit EZInfo 3.0 (Umetrics) können Sie auch erweiterte Statistiken für den Zugriff auf Funktionen wie überwachte Analyse und S-Plots nutzen.
Reduzieren Sie Engpässe und optimieren Sie Workflows
Der menübasierte Workflow in Progenesis QI führt Anwender durch die Versuchsschritte in der Software. Falls gewünscht, können Anwender mithilfe von Automatisierungsroutinen die verschiedenen Phasen nahtlos durchlaufen, um die Möglichkeit einer unbeaufsichtigten Datenverarbeitung über Nacht und über das Wochenende zu nutzen. Mit Progenesis QI erhalten Sie:
- Automatische Auswahl der Referenzmessung und automatischer Abgleich
- Automatische Peakauswahl und Normalisierung
- Automatische Generierung des Versuchsdesigns aus .CSV- und .SPL-Dateien
- Alle Phasen bis zur Identifizierung von Verbindungen automatisierbar
Die Optimierung von omics-Experimenten beginnt mit der Verringerung des Engpasses, den die Interpretation der Liste der gefundenen Daten darstellt: Welche Biologie steckt hinter den beobachteten Veränderungen? Eine Möglichkeit, diese Frage zu beantworten und größtmöglichen Nutzen aus den omics-Daten zu ziehen, ist die Pathway Analysis. Progenesis QI verfügt über Tools zum Exportieren von Daten, sodass Sie schnell und einfach Drittanbieter-Programme für die Stoffwechselweganalyse nutzen können.
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