Progenesis QI
Descubra los compuestos que cambian significativamente en sus muestras
El software Progenesis QI permite cuantificar e identificar con exactitud compuestos en las muestras que cambian significativamente, con compatibilidad con un flujo de trabajo guiado por menús altamente intuitivo. El software Progenesis QI ayuda a superar los desafíos del análisis de datos, lo que permite descubrir compuestos de interés de forma rápida, objetiva y fiable, y exportar resultados para aplicaciones de investigación ómica.
Progenesis QI no depende de la plataforma del instrumento, y admite formatos universales como .mzML y .mzXML. Para obtener más información acerca de Progenesis QI, consulte www.nonlinear.com.
Progenesis QI
Descripción general
- Busque datos de compuestos de forma flexible con ChemSpider, Composición elemental, Metlin o el método de búsqueda de Waters, MetaScope
- Reduzca los ID de falsos positivos mediante el uso de varios parámetros de búsqueda: masa exacta, fragmentos de MS/MS, distribución de isótopos, RT y CCS
- Importe los resultados de identificación, incluidas las estructuras químicas de las bases de datos SDF y los enlaces web integrados a los detalles del compuesto
- Encuentre rápidamente compuestos que cambian significativamente, p. ej., valor p de Anova, pliegues de cambio, potencia
- Visualice la abundancia relativa de compuestos utilizando gráficos de perfil de abundancia de compuestos
- Integre fácilmente los resultados con otras plataformas bioinformáticas con opciones integrales de exportación de datos
- Revise y edite la deconvolución de aductos de compuestos utilizada para cuantificar e identificar un compuesto.
Uso recomendado: Para descubrir de forma rápida, objetiva y fiable compuestos de interés en el análisis de datos de LC-MS.
Encabezado de características
Resolución de datos complejos con una potente visualización
Una de las funciones clave de Progenesis QI son las representaciones de datos sumamente atractivas y gráficas, que permiten a los usuarios visualizar y comprender por completo sus datos y, por tanto, le ofrecen una confianza adicional en las mediciones realizadas. Los mapas de intensidad iónica, que muestran una representación en 2D del tiempo de retención cromatográfico, los valores m/z y la intensidad característica, así como los espectros de masas y cromatogramas, proporcionan garantía de calidad de la alineación automática, la selección de picos y la deconvolución de aductos en cada muestra.
Cuantificación de compuestos con gran exactitud
Progenesis QI proporciona mediciones precisas y exactas de compuestos basadas en la suma de las intensidades iónicas. Los aductos de los compuestos se deconvolucionan automáticamente para proporcionar una cuantificación exacta a partir de todos los datos disponibles. Tras la cuantificación, es posible identificar los compuestos con cambios de abundancia estadísticamente significativos entre grupos. Se puede explorar un gran número de muestras de múltiples grupos, junto con diversos diseños de comparación, en un solo experimento. El resultado es una lista de compuestos de interés para una caracterización posterior.
Identificación fiable de compuestos con diversos parámetros de búsqueda
Progenesis QI permite a los usuarios identificar compuestos en base no solo a la masa neutra, la distribución isotópica y el tiempo de retención cromatográfico, sino también utilizando datos de fragmentos de MS/MS y mediciones de la sección transversal de colisión (CSS) mediante el nuevo motor de búsqueda Metascope de Waters. Las búsquedas realizadas en bases de datos con diversos parámetros mejoran considerablemente la especificidad de la búsqueda y aumentan la probabilidad de una identificación correcta de compuestos.
Encuentre compuestos de interés con mayor facilidad
La identificación de compuestos sigue siendo uno de los principales impedimentos de los experimentos ómicos de moléculas pequeñas; por tanto, proporcionamos acceso a una amplia variedad de bases de datos para aumentar las probabilidades de encontrar los compuestos de interés. Los métodos de búsqueda de compuestos flexibles incluyen:
- Cualquier base de datos en formato .SDF
- Bases de datos internas en formato .CSV
- Base de datos Metlin
- Bases de datos de la Royal Society of Chemistry con el complemento ChemSpider
- Bibliotecas de NIST para MS/MS y MS
También puede buscar compuestos de interés con las herramientas estadísticas que forman parte de Progenesis QI, entre las que se incluyen las siguientes:
- ANOVA
- Análisis de componentes principales (PCA)
- Análisis clúster jerárquico
También se pueden aprovechar las estadísticas avanzadas a través de la integración perfecta con EZInfo 3.0 (Umetrics) para acceder a funciones como el análisis supervisado y los gráficos s.
Reduzca los cuellos de botella y optimice los flujos de trabajo
El flujo de trabajo guiado por menús de Progenesis QI guía a los usuarios a través de los pasos experimentales del software. Si es necesario, las rutinas de automatización permiten a los usuarios avanzar sin dificultad por las diferentes etapas para maximizar las posibilidades de procesamiento de datos sin supervisión durante la noche y el fin de semana. Con Progenesis QI, obtendrá:
- Selección y alineación automáticas del análisis de referencia
- Normalización y selección automáticas de picos
- Diseño experimental automatizado a partir de archivos .CSV y .SPL
- Todas las etapas son automatizables hasta el momento de la identificación de compuestos
La simplificación de los experimentos ómicos comienza con la reducción del cuello de botella en la interpretación de la lista de descubrimientos: ¿cuál es la biología detrás de los cambios observados? Una forma de abordar esta pregunta y extraer el máximo valor de los datos de descubrimiento ómicos es Pathway Analysis. Progenesis QI incluye herramientas de exportación para interactuar de forma fácil y rápida con los programas de análisis de vías de terceros.
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Preguntas frecuentes
¿Qué es el software Progenesis QI?
La solución de software Progenesis QI de Waters permite a los usuarios cuantificar e identificar con exactitud compuestos que cambian significativamente en diversas muestras. Se ha diseñado para optimizar el proceso de análisis de datos de LC-MS y ofrece soporte para formatos de datos comunes, lo que proporciona flexibilidad en diferentes plataformas de instrumentos. Con su flujo de trabajo intuitivo guiado por menús, Progenesis QI aborda los desafíos del análisis de datos y facilita el descubrimiento rápido, objetivo y fiable de compuestos de interés para aplicaciones de investigación ómica.
La clave de su utilidad es la independencia de la plataforma de instrumentos del software, con soporte para formatos universales como .mzML y .mzXML, lo que permite a los usuarios buscar identificaciones de compuestos utilizando una gran cantidad de parámetros que incluyen masa exacta, fragmentos MS/MS, distribución de isótopos, tiempo de retención (RT) y sección transversal de colisión (CCS).
Progenesis QI simplifica el proceso de identificación con la selección automática de la ejecución de referencia, la selección de picos y la normalización, lo que permite una integración perfecta con las plataformas bioinformáticas a través de opciones completas de exportación de datos. Permite a los usuarios visualizar datos a través de pantallas gráficas, incluidos mapas de intensidad iónica y vistas de datos cromatográficos, para una mayor confianza en las mediciones realizadas.
Además, Progenesis QI fomenta la exploración de la importancia biológica detrás de los cambios observados a través de herramientas para Pathway Analysis (Análisis de vías), junto con herramientas estadísticas comunes para análisis como ANOVA, PCA y clústeres jerárquicos. Este robusto conjunto de funciones garantiza que Progenesis QI sea la opción recomendada para los investigadores que buscan superar los cuellos de botella en los experimentos ómicos de moléculas pequeñas, pues proporciona una base fiable para el descubrimiento y el análisis.
¿Se puede utilizar el software Progenesis QI para procesar otros datos de espectrometría de masas?
Sí, el software Progenesis QI es compatible con los datos de espectrometría de masas convertidos al formato común mzML, lo que permite un análisis de datos sin problemas.
¿Qué tan fácil de usar es el software Progenesis QI para los científicos y técnicos de laboratorio?
El software Progenesis QI está diseñado con una interfaz fácil de usar, lo que facilita a los científicos y técnicos de laboratorio la navegación y el análisis de datos complejos de espectrometría de masas.
¿El software Progenesis QI puede gestionar de forma eficiente grandes conjuntos de datos?
Sí, el software Progenesis QI está equipado para gestionar grandes conjuntos de datos de forma eficaz, lo que permite un análisis rápido y preciso de los datos de espectrometría de masas.
¿El software Progenesis QI ofrece herramientas de análisis estadístico?
Sí, el software Progenesis QI ofrece herramientas de análisis estadístico comunes, lo que permite a los científicos y técnicos de laboratorio realizar análisis estadísticos detallados de sus datos de espectrometría de masas.
¿Hay soporte técnico disponible para los usuarios del software Progenesis QI?
Sí, el soporte técnico está disponible para los usuarios del software Progenesis QI, lo que garantiza que los científicos y los técnicos de laboratorio tengan acceso a asistencia y orientación cuando sea necesario.
