イメージング質量分析（MS イメージング）により、さまざまな表面から直接、またはマトリックスを介して、化学情報を得ることができます。MS イメージングでは、情報量の多い鮮明なイメージとともに、表面もしくはその周辺の分子の空間分布についての情報が得られ、チームは「この成分はサンプル中のどこに存在するのか？」という基礎的な疑問に答えることができます。
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