Progenesis QI

Progenesis QI

Repérez les composés qui varient significativement dans vos échantillons

Repérez les composés qui varient significativement dans vos échantillons

Proposant un workflow très intuitif guidé par des menus, le logiciel Progenesis QI vous permet de quantifier et d’identifier avec exactitude les composés qui changent de manière significative dans vos échantillons. Le logiciel Progenesis QI vous aide à relever les défis de l’analyse de données en vous permettant de détecter de manière rapide, objective et fiable des composés d’intérêt et d’exporter les résultats pour des applications de recherche en sciences omiques.

Le logiciel Progenesis QI est une plateforme indépendante qui prend en charge les formats universels tels que .mzML et .mzXML. Pour plus d’informations sur le logiciel Progenesis QI, consultez le site Internet www.nonlinear.com.

Progenesis QI Software Progenesis QI

Présentation

  • Recherchez facilement les données de composés à l’aide de LipidBlast, ChemSpider, Elemental Composition, Metlin ou de la méthode de recherche MetaScope de Waters.
  • Réduisez le nombre de faux positifs en utilisant plusieurs paramètres de recherche : masse exacte, fragments MS/MS, distribution des isotopes, temps de rétention et section efficace de collision (CCS).
  • Importez les résultats d’identification, y compris les structures chimiques à partir de bases de données au format SDF et des liens Internet intégrés dans les détails des composés.
  • Trouvez rapidement des composés qui changent significativement, par exemple en fonction de la valeur p de l’analyse de variance (ANOVA), du facteur de variation ou de la puissance.
  • Visualisez l’abondance relative des composés à l’aide des graphiques de profil d’abondance des composés.
  • Intégrez facilement les résultats avec d’autres plateformes bio-informatiques à l’aide d’options complètes d’exportation des données.
  • Vérifiez et modifiez la déconvolution des adduits de composé utilisée pour quantifier et identifier un composé.

Utilisation recommandée : pour détecter de manière rapide, objective et fiable des composés d’intérêt lors de l’analyse de données LC/MS.


En-tête des fonctionnalités

En-tête des fonctionnalités






Donnez du sens aux données complexes grâce à un affichage performant

Le logiciel Progenesis QI propose une fonctionnalité intégrant un affichage de données hautement graphique et attrayant qui permet de visualiser et de comprendre pleinement les données, pour des mesures plus fiables. Les cartographies d’intensité des ions illustrant en deux dimensions le temps de rétention, le rapport m/z et les intensités ainsi que l’affichage des données de spectrométrie de masse et des chromatogrammes constituent une assurance qualité des procédés d’alignement automatique, de sélection des pics et de déconvolution des adduits pour chaque échantillon.


Quantification exacte des composés

Le logiciel Progenesis QI mesure avec exactitude et fidélité les paramètres des composés à partir de la somme des intensités des ions. Les adduits des composés sont automatiquement déconvolués, pour une quantification exacte à partir de toutes les données disponibles. Il est alors possible d’identifier les composés dont l’abondance varie de façon statistiquement significative d’un groupe à l’autre. Un grand nombre d’échantillons de différents groupes peut être exploré, ainsi que divers systèmes de comparaison au sein d’une seule expérience. Le résultat consiste en une liste de composés d’intérêt destinés à être ensuite caractérisés.


Identification fiable des composés grâce à de nombreux paramètres de recherche

Le logiciel Progenesis QI permet d’identifier les composés non seulement à partir de la masse neutre, de la distribution isotopique et du temps de rétention, mais également à partir des fragments MS/MS et des mesures de la section efficace de collision (CSS) à l’aide du nouveau moteur de recherche Metascope de Waters. La recherche dans les bases de données avec différents paramètres améliore considérablement la spécificité des recherches et augmente les chances d’une identification correcte de vos composés.


Identifiez plus facilement les composés d’intérêt

L’identification des composés demeure toujours l’un des principaux goulots d’étranglement dans les études dites « omiques » des petites molécules. Nous offrons donc un accès à de nombreuses bases de données afin d’améliorer vos chances de trouver vos composés d’intérêt. Les différentes méthodes de recherche de composés proposées sont notamment les suivantes :

  • Toutes les bases de données au format .SDF
  • Bases de données internes au format .CSV
  • Base de données Metlin
  • Bases de données de la Royal Society of Chemistry à l’aide du module ChemSpider
  • Base de données Lipidblast
  • Bibliothèques MS/MS et NIST MS

Vous pouvez également trouver des composés d’intérêt à l’aide d’outils statistiques compris dans le logiciel Progenesis QI, notamment :

  • Analyse de variance (ANOVA)
  • Analyse en composantes principales (PCA)
  • Regroupement hiérarchique

Vous pouvez également tirer parti de statistiques avancées via une parfaite intégration avec EZInfo 3.0 (Umetrics) pour accéder à des fonctions telles que l’analyse supervisée et les tracés S-Plot.


Réduisez les goulots d’étranglement et rationalisez les procédures

Grâce à ses menus interactifs, la méthodologie du logiciel Progenesis QI guide les utilisateurs à travers les étapes expérimentales du logiciel. Si nécessaire, l’automatisation des tâches permet de parcourir sans encombre les différentes étapes afin de multiplier les possibilités de traitement sans surveillance des données pendant la nuit ou le week-end. Avec Progenesis QI, vous bénéficiez des atouts suivants :

  • Sélection et alignement automatiques de l’analyse de référence
  • Normalisation et sélection automatiques des pics
  • Conception expérimentale automatisée à partir de fichiers .CSV et .SPL
  • Automatisation possible de toutes les étapes, jusqu’à l’identification des composés

La rationalisation des expériences en sciences omiques commence par réduire le goulot d’étranglement au niveau de l’interprétation de la liste des découvertes : quel est le processus biologique sous-jacent aux changements observés ? L’analyse des voies biologiques, ou « Pathway Analysis », permet de répondre à cette question et de valoriser au mieux les données des recherches en sciences omiques. Le logiciel Progenesis QI offre des outils d’exportation permettant de le lier rapidement et facilement à d’autres programmes de Pathway Analysis.


Ressources

Documents

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Assistance

Assistance



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Progenesis QI

Le logiciel Progenesis QI est une solution de pointe pour quantifier avec précision et identifier les composés qui changent de manière significative dans divers échantillons. Conçu pour rationaliser le processus d'analyse des données LC-MS, il offre un support complet pour plusieurs formats de données de fournisseurs courants, garantissant une flexibilité sur différentes plateformes d'instruments. Avec son flux de travail intuitif et guidé par menu, Progenesis QI répond aux défis de l'analyse de données, facilitant la découverte rapide, objective et fiable de composés d'intérêt pour les applications de recherche omiques.

La clé de son utilité est l'indépendance de la plateforme d'instrument du logiciel, avec un support pour des formats universels comme .mzML et .mzXML, et permettant aux utilisateurs de rechercher des identifications de composés en utilisant une multitude de paramètres, y compris la masse exacte, les fragments MS/MS, la distribution isotopique, le temps de rétention (RT) et la section transversale de collision (CCS).

Progenesis QI simplifie le processus d'identification avec sa sélection automatique de course de référence, sa sélection de pics et sa normalisation, soutenant une intégration transparente avec les plateformes de bioinformatique grâce à des options d'exportation de données complètes. Il permet aux utilisateurs de visualiser les données à travers des affichages hautement graphiques, y compris des cartes d'intensité d'ions et des vues de données chromatographiques, pour une confiance accrue dans les mesures effectuées.

De plus, Progenesis QI encourage l'exploration de la signification biologique derrière les changements observés grâce à des outils pour l'analyse des voies, ainsi que des outils statistiques avancés pour l'analyse tels que ANOVA, PCA et le clustering hiérarchique. Cette robuste suite de fonctionnalités garantit que Progenesis QI est le choix recommandé pour les chercheurs cherchant à surmonter les goulots d'étranglement dans les expériences omiques de petites molécules, fournissant une base fiable pour la découverte et l'analyse.

FAQ sur le logiciel Progenesis QI

Le logiciel Progenesis QI peut-il être intégré à d'autres instruments de spectrométrie de masse?
Oui, le logiciel Progenesis QI est compatible avec une large gamme d'instruments de spectrométrie de masse, permettant une intégration et une analyse des données sans faille.

Le logiciel Progenesis QI est-il convivial pour les scientifiques et les techniciens de laboratoire?
Le logiciel Progenesis QI est conçu avec une interface conviviale, ce qui facilite la navigation et l'analyse des données complexes de spectrométrie de masse pour les scientifiques et les techniciens de laboratoire.

Le logiciel Progenesis QI peut-il gérer efficacement de grands ensembles de données?
Oui, le logiciel Progenesis QI est équipé pour gérer efficacement de grands ensembles de données, permettant une analyse rapide et précise des données de spectrométrie de masse.

Le logiciel Progenesis QI offre-t-il des outils avancés d'analyse statistique?
Oui, le logiciel Progenesis QI offre des outils avancés d'analyse statistique, permettant aux scientifiques et aux techniciens de laboratoire d'effectuer une analyse statistique approfondie de leurs données de spectrométrie de masse.

Un support technique est-il disponible pour les utilisateurs du logiciel Progenesis QI?
Oui, un support technique est disponible pour les utilisateurs du logiciel Progenesis QI, garantissant que les scientifiques et les techniciens de laboratoire ont accès à l'aide et aux conseils nécessaires.