Enzymes RapiZyme pour la digestion rapide de protéines et d’ARN

Enzymes RapiZyme pour la digestion rapide de protéines et d’ARN

Les enzymes RapiZyme de Waters permettent une digestion précise et hautement efficace des protéines et des acides nucléiques thérapeutiques, afin de prendre en charge leur caractérisation biophysique et leur quantification avec les procédures LC/MS . 

Les enzymes RapiZyme de Waters permettent une digestion précise et hautement efficace des protéines et des acides nucléiques thérapeutiques, afin de prendre en charge leur caractérisation biophysique et leur quantification avec les procédures LC/MS . 

Présentation

La cartographie peptidique et oligonucléotidique est un processus essentiel pour confirmer l’identité, la pureté et la séquence de biomolécules complexes comme les protéines ou l’ARN thérapeutiques. Conçus pour l’analyse LC/MS des produits biothérapeutiques modernes, les enzymes RapiZyme permettent des digestions rapides et reproductibles pour :

  • Trypsine résistante à l’autolyse pour une cartographie rapide à haute couverture peptidique
  • ARNases spécifiques aux dinucléotides (MC1, Cusativin) pour le séquençage des ARNm/ARNsg 
  • Protéinase K recombinante hautement active exempte de nucléases, destinée à la digestion des protéines

Ces outils permettent d’obtenir des procédures de caractérisation robustes et de haute résolution dans le domaine de la biothérapeutique moderne pour les utilisateurs de LC/MS . Amélioration du temps de traitement des échantillons et des opérations de laboratoire, et prise de décisions critiques rapide et en toute confiance avec les solutions Waters.

Solutions

Bénéficiez de digestion rapide, propre et complète des protéines

Bénéficiez de digestion rapide, propre et complète des protéines
Trypsine RapiZyme

Bénéficiez de digestion rapide, propre et complète des protéines pour la cartographie peptidique. La trypsine RapiZyme est une trypsine recombinante chimiquement optimisée qui ne nécessite pas de traitement par un inhibiteur TPCK, ce qui permet d’obtenir des résultats reproductibles et une récupération plus élevée. Obtenez des données fiables en seulement 30 minutes, sans compromettre la forme des picc et les lignes de base. 

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  • Peptide Mapping
  • Recherche et découverte protéomique
  • Bioanalyse

Bénéficiez d’une élimination rapide et efficace des protéines pour la bioanalyse des acides nucléiques

Bénéficiez d’une élimination rapide et efficace des protéines pour la bioanalyse des acides nucléiques
Protéinase K RapiZyme

Obtenez une digestion efficace des protéines grâce au module de digestion de la protéinase K recombinante hautement actif, sans détergent, sans nucléase et compatible LC-MS. Idéal pour l’extraction d’oligonucléotides destinés à des applications de bioanalyse, le module de digestion de la protéinase K permet également d’analyser l’efficacité d’encapsidation des vecteurs viraux et de déterminer la proportion d’acides nucléiques libres par rapport aux acides nucléiques encapsidés.

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  • Séquençage de l’ARN
  • Bioanalyse

Digestion d’ARN programmables avec une spécificité de cytidine

Digestion d’ARN programmables avec une spécificité de cytidine
RapiZyme Cusativin

Digestion partielle de l’ARN pour le séquençage LC/MS. Accélérez le séquençage LC-MS avec RapiZyme Cusativin, une endoribonucléase recombinante qui clive à l’extrémité 3’ de la cytidine, produisant des produits plus longs pour une couverture de séquence plus élevée et des attributions fiables.

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  • Bioanalyse

Réalisez une digestion sélective et reproductible de l’ARN pour le séquençage LC/MS.

Réalisez une digestion sélective et reproductible de l’ARN pour le séquençage LC/MS.
RapiZyme MC1

Améliorez la couverture des séquences avec RapiZyme MC1. Cette ARNase recombinante clive à l’extrémité 5’ de l’uridine, produisant des produits uniques qui améliorent la couverture des séquences LC/MS et sont complémentaires à RapiZyme Cusativin. 

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Applications

Obtenez une couverture des séquences élevée et des lignes de base nettes en seulement 30 minutes avec la trypsine RapiZyme, une digestion protéique rapide et reproductible pour LC/MS. Cette trypsine résistant à l’autolyse permet de cartographier les peptides et d’effectuer une protéomique ascendante pour les anticorps monoclonaux et d’autres protéines thérapeutiques.

Obtenez une couverture des séquences élevée et des lignes de base nettes en seulement 30 minutes avec la trypsine RapiZyme, une digestion protéique rapide et reproductible pour LC/MS. Cette trypsine résistant à l’autolyse permet de cartographier les peptides et d’effectuer une protéomique ascendante pour les anticorps monoclonaux et d’autres protéines thérapeutiques.

Notes d’application

Bols de céréales sur une table

Comparaison de digestifs 1:5 entre un concurrent leader du secteur (panneau supérieur) et la trypsine RapiZyme (panneau inférieur), avec section agrandie de la fenêtre de temps de rétention de 14 à 40 min. Les flèches rouges mettent en évidence l’autolyse de la trypsine et les pics inconnus.

Générez des fragments d’ARN qui se chevauchent grâce à une digestion réglable au niveau des sites riches en uridine et cytidine à l’aide des ARNases RapiZyme MC1 et Cusativin pour la digestion de l’ARN en vue de la cartographie des oligonucléotides. Améliorez la couverture de séquence et l’identification des pics pour les vaccins à ARNm et les ARN guides CRISPR.

Générez des fragments d’ARN qui se chevauchent grâce à une digestion réglable au niveau des sites riches en uridine et cytidine à l’aide des ARNases RapiZyme MC1 et Cusativin pour la digestion de l’ARN en vue de la cartographie des oligonucléotides. Améliorez la couverture de séquence et l’identification des pics pour les vaccins à ARNm et les ARN guides CRISPR.

Notes d’application

Bols de céréales sur une table

Analyse par LC-UV-MS de l’ARNsg HPRT digéré avec RapiZyme Cusativin et MC1 recombinantes. Trois lots indépendants d’enzymes recombinantes de RapiZyme Cusativin (A) et de RapiZyme MC1 (B) ont été utilisés pour digérer de l’ARNsg HPRT. Les trois chromatogrammes UV (tracés noirs, bleus et rouges) sont superposés l’un au-dessus de l’autre pour indiquer la reproductibilité du comportement de digestion de trois préparations. (C) Superposition du chromatogramme d’ion extrait des produits de digestion RapiZyme Cusativin identifiés, indiquant leur abondance dans le tracé TUV correspondant. (D) Superposition du chromatogramme d’ion extrait des produits de digestion RapiZyme MC1 identifiés, indiquant leur abondance dans le tracé TUV correspondant. Le profil des produit de digestion à faible abondance des produits de digestion RapiZyme MC1 est illustré sur la figure en encart.

Contrôlez la digestion enzymatique de l’ARNm à l’aide d’ARNases RapiZyme, permettant l’analyse de l’identité, de la pureté et de la séquence de l’ARNm. Les ARNases RapiZyme permettent d’obtenir des produits de digestion plus longs avec des masses uniques, ce qui contribue à réduire les ambiguïtés susceptibles d’apparaître avec les produits de digestion isobarique. En plus de la détermination de la séquence, d’autres attributs de qualité critiques (CQA), tels que la coiffe 5’ et l’hétérogénéité de la traînée poly A, peuvent être évalués sans recourir à des approches hybrides ou basées sur la sonde.  

Contrôlez la digestion enzymatique de l’ARNm à l’aide d’ARNases RapiZyme, permettant l’analyse de l’identité, de la pureté et de la séquence de l’ARNm. Les ARNases RapiZyme permettent d’obtenir des produits de digestion plus longs avec des masses uniques, ce qui contribue à réduire les ambiguïtés susceptibles d’apparaître avec les produits de digestion isobarique. En plus de la détermination de la séquence, d’autres attributs de qualité critiques (CQA), tels que la coiffe 5’ et l’hétérogénéité de la traînée poly A, peuvent être évalués sans recourir à des approches hybrides ou basées sur la sonde.  

Notes d’application

Bols de céréales sur une table

Caractérisation des différentes formes d’oligonucléotides coiffés en 5’ dans le digest par l’ARNase MC1 de l’ARNm 1 (XIC pour le panneau supérieur, le spectre de masse pour le panneau central, carte à points des ions fragments MSE pour le panneau inférieur). Détection de l’oligonucléotide coiffé (a), de la forme non méthylée de la version coiffée (b) et de la version non coiffée (c).

Permettez une digestion rapide et non spécifique des protéines pour libérer les acides nucléiques des échantillons complexes avec la Protéinase K RapiZyme. Elle est idéale pour les workflows de thérapie génique. Elle améliore la récupération des acides nucléiques, prend en charge les études DMPK et garantit des résultats de haute qualité avec des réactifs sans nucléase certifiés.

Permettez une digestion rapide et non spécifique des protéines pour libérer les acides nucléiques des échantillons complexes avec la Protéinase K RapiZyme. Elle est idéale pour les workflows de thérapie génique. Elle améliore la récupération des acides nucléiques, prend en charge les études DMPK et garantit des résultats de haute qualité avec des réactifs sans nucléase certifiés.

Notes d’application

Bols de céréales sur une table

Démonstration des performances d’extraction des oligonucléotides pour GEM91, GEM132 et pour un ASO lipidique conjugué à partir de tissus cérébraux porcins. Les récupérations ont été déterminées comme étant ≥ 80 % avec une excellente répétabilité (écarts-types ≤ 10 %) (A). La linéarité de l’extraction a été déterminée comme étant ≥ 0,99 sans correction par un étalon interne (B) en utilisant une homogénéisation et une digestion du tissu Protéinase K assistées par solvant, suivies d’un mélange Purification en mode SPE à l’aide de la microplaque SPE et des réactifs OligoWorks.

Réalisez une digestion des protéines à haut débit avec la trypsine RapiZyme. Accélérez les tests de cartographie peptidique afin de déterminer l’identité et de détecter les modifications post-traductionnelles (PTM), les variants de séquence ou les produits de dégradation.  Elle prend également en charge l’automatisation et les workflows LC/MS à haut débit dans le développement de bioprocédés.

Réalisez une digestion des protéines à haut débit avec la trypsine RapiZyme. Accélérez les tests de cartographie peptidique afin de déterminer l’identité et de détecter les modifications post-traductionnelles (PTM), les variants de séquence ou les produits de dégradation.  Elle prend également en charge l’automatisation et les workflows LC/MS à haut débit dans le développement de bioprocédés.

Notes d’application

Bols de céréales sur une table

Chromatogrammes de masse extraits pour deux peptides HCP de faible abondance identifiés dans la digestion du mAb NIST à l’aide de l’analyse HCP de découverte.

Webinaires et ressources

  • Guide d’applications

Cartographie peptidique pour les produits biothérapeutiques

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  • Infographie

RapiZyme : Infographie rapide, net et complet

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  • Infographie

RapiZyme – Infographie à l’utilisation flexible

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  • Webinaire à la demande

Fragmentation du code : analyse de l’ARNm et de l’ARNsg avec des enzymes, des spectrométries de masse et des solutions informatiques avancées

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  • Webinaire à la demande

Cartographie peptique rapide, propre et complète pour les mAbs

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  • Webinaire à la demande

Manuel MRNA

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  • User Manuals

Manuel d’initiation rapide des ARNases RapiZyme

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