Progenesis QI
Entdecken Sie sich signifikant ändernde Verbindungen in Ihren Proben
Die Progenesis QI Software ermöglicht Ihnen genaues Quantifizieren und Identifizieren von Verbindungen in Ihren Proben, die sich signifikant ändern. Sie bietet einen äußerst intuitiven, menügeführten Workflow. Die Progenesis QI Software hilft Ihnen dabei, Herausforderungen bei der Datenanalyse zu meistern. Verbindungen von Interesse können schnell, objektiv und zuverlässig gefunden und die Ergebnisse für omics-Forschungsapplikationen exportiert werden.
Progenesis QI ist eine unabhängige Geräteplattform, die universelle Formate wie .mzML und .mzXML unterstützt. Mehr Informationen über Progenesis QI finden Sie unter www.nonlinear.com.
Progenesis QI
Übersicht
- Flexibles Durchsuchen von Verbindungsdaten mit ChemSpider, Elemental Composition, Metlin oder der Waters Suchmethode MetaScope
- Verringern falsch-positiver IDs durch Verwendung mehrerer Suchparameter: exakte Masse, MS/MS-Fragmente, Isotopenverteilung, Retentionszeit (RT) und Stoßquerschnittsmessungen (CCS)
- Importieren von Identifizierungsergebnissen, einschließlich chemischer Strukturen aus SDF-Datenbanken und eingebetteter Weblinks zu Verbindungsdetails
- Finden Sie schnell sich signifikant ändernde Verbindungen, z. B. ANOVA, p-Wert, Fold Change (x-fache Änderung), Potenz
- Schnelles Auffinden von sich signifikant ändernden Verbindungen, z. B. Anova p-Wert, Fold-change, Potenz
- Einfache Integration von Ergebnissen mit anderen Bioinformatik-Plattformen mit umfassenden Optionen für den Datenexport
- Überprüfen und Bearbeiten der Adduktdekonvolution von Verbindungen, die zur Quantifizierung und Identifizierung einer Verbindung verwendet wird
Empfohlene Verwendung: Für das schnelle, objektive und zuverlässige Auffinden von interessierenden Verbindungen bei der LC-MS-Datenanalyse.
Features Header
Nutzen Sie komplexe Daten dank leistungsfähiger Visualisierung
Eine der wichtigsten Funktionen von Progenesis QI ist die sehr anschauliche und ansprechende Darstellung der Daten, dank derer Anwender Daten vollständig visualisieren und verstehen können. So erhalten sie noch mehr Vertrauen in die durchgeführten Messungen. Ionenintensitätskarten, die eine zweidimensionale Darstellung von chromatographischer Retentionszeit, m/z-Wert und Intensität zeigen, sowie Darstellungen von MS- und Chromatographiedaten können zur Qualitätssicherung der automatischen Vorgänge wie Abgleich, Peakauswahl und Adduktdekonvolution von Verbindungen für jede Probe genutzt werden.
Hochpräzise Quantifizierung von Verbindungen
Progenesis QI liefert exakte und präzise Messungen von Verbindungen basierend auf der Summe der Ionenintensitäten. Verbindungsaddukte werden automatisch dekonvuliert und bieten somit eine genaue Quantifizierung mit allen verfügbaren Daten. Im Anschluss an die Quantifizierung können die Verbindungen identifiziert werden, die eine statistisch signifikante Mengenänderung beim Vergleich verschiedener Gruppen aufweisen. Große Mengen an Proben aus unterschiedlichen Gruppen können analysiert werden, auch unter Anwendung unterschiedlicher Vergleichsdesigns innerhalb eines Versuchs. Das Ergebnis ist eine Liste von Verbindungen, die für die weitere Charakterisierung von Interesse sind.
Sichere Identifizierung von Verbindungen mit verschiedenen Suchparametern
Progenesis QI ermöglicht Anwendern die Identifizierung von Verbindungen nicht nur basierend auf der neutralen Masse, der Isotopenverteilung und der chromatographischen Retentionszeit, sondern auch anhand von MS/MS-Fragmentdaten und Stoßquerschnittsmessungen (CCS) mithilfe von Metascope, der neuen Suchmaschine von Waters. Die Datenbanksuche anhand mehrerer Parameter verbessert die Genauigkeit der Suche enorm und erhöht die Wahrscheinlichkeit einer korrekten Identifizierung von Verbindungen.
Leichteres Auffinden von Verbindungen von Interesse
Das Identifizieren von Verbindungen ist noch immer eine der größten Herausforderungen bei omics-Versuchen mit kleinen Molekülen. Wir bieten Ihnen Zugang zu zahlreichen Datenbanken, um Ihre Erfolgschancen beim Auffinden interessierender Verbindungen zu erhöhen. Zu den flexiblen Methoden der Verbindungssuche gehören:
- Alle Datenbanken im .SDF-Format
- Interne Datenbanken im .CSV-Format
- Metlin-Datenbank
- Datenbanken der Royal Society of Chemistry mit ChemSpider-Plugin
- NIST MS- und MS/MS-Bibliotheken
Finden Sie Verbindungen von Interesse mithilfe von Statistiktools in Progenesis QI, darunter:
- ANOVA
- Hauptkomponentenanalyse (PCA)
- Hierarchische Clusteranalyse
Über die nahtlose Integration mit EZInfo 3.0 (Umetrics) können Sie auch erweiterte Statistiken für den Zugriff auf Funktionen wie überwachte Analyse und S-Plots nutzen.
Reduzieren Sie Engpässe und optimieren Sie Workflows
Der menübasierte Workflow in Progenesis QI führt Anwender durch die Versuchsschritte in der Software. Falls gewünscht, können Anwender mithilfe von Automatisierungsroutinen die verschiedenen Phasen nahtlos durchlaufen, um die Möglichkeit einer unbeaufsichtigten Datenverarbeitung über Nacht und über das Wochenende zu nutzen. Mit Progenesis QI erhalten Sie:
- Automatische Auswahl der Referenzmessung und automatischer Abgleich
- Automatische Peakauswahl und Normalisierung
- Automatische Generierung des Versuchsdesigns aus .CSV- und .SPL-Dateien
- Alle Phasen bis zur Identifizierung von Verbindungen automatisierbar
Die Optimierung von omics-Experimenten beginnt mit der Verringerung des Engpasses, den die Interpretation der Liste der gefundenen Daten darstellt: Welche Biologie steckt hinter den beobachteten Veränderungen? Eine Möglichkeit, diese Frage zu beantworten und größtmöglichen Nutzen aus den omics-Daten zu ziehen, ist die Pathway Analysis. Progenesis QI verfügt über Tools zum Exportieren von Daten, sodass Sie schnell und einfach Drittanbieter-Programme für die Stoffwechselweganalyse nutzen können.
Ressourcen
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Häufig gestellte Fragen
Was ist die Progenesis QI Software?
Die Waters Progenesis QI Software-Lösung ermöglicht es Benutzern, sich signifikant ändernde Verbindungen in verschiedenen Proben genau zu quantifizieren und zu identifizieren. Sie wurde entwickelt, um den Prozess der LC-MS-Datenanalyse zu optimieren, und bietet Unterstützung für gängige Datenformate sowie Flexibilität für unterschiedliche Geräteplattformen. Mit ihrem intuitiven, menügeführten Workflow bewältigt Progenesis QI Herausforderungen bei der Datenanalyse und erleichtert die schnelle, objektive und zuverlässige Entdeckung relevanter Verbindungen für Omics-Forschungsanwendungen.
Der Schlüssel zu ihrem Nutzen liegt in der Unabhängigkeit der Software von der Geräteplattform mit Unterstützung für universelle Formate wie .mzML und .mzXML. Dies ermöglicht es Benutzern, anhand einer Fülle von Parametern nach Verbindungsidentifizierungen zu suchen, einschließlich exakter Masse, MS/MS-Fragmenten, Isotopenverteilung, Retentionszeit (RT) und Stoßquerschnitt (CCS).
Progenesis QI vereinfacht den Identifizierungsprozess durch die automatische Auswahl der Referenzmessung, die Peakauswahl und die Normalisierung und unterstützt durch umfassende Optionen für den Datenexport eine nahtlose Integration mit Bioinformatik-Plattformen. Sie ermöglicht es Benutzern, Daten durch grafische Anzeigen zu visualisieren, einschließlich Ionenintensitätskarten und Ansichten von Chromatographiedaten, was zusätzliches Vertrauen in die durchgeführten Messungen schafft.
Darüber hinaus fördert Progenesis QI die Untersuchung der biologischen Signifikanz hinter beobachteten Veränderungen mithilfe von Tools für die Pathway Analysis, neben gebräuchlichen statistischen Tools für die Analyse wie ANOVA, PCA und hierarchischer Clusteranalyse. Diese robuste Funktionssuite stellt sicher, dass Progenesis QI die empfohlene Wahl für Forscher ist, die Engpässe bei omics-Experimenten mit kleinen Molekülen überwinden möchten, und bietet eine zuverlässige Grundlage für Entdeckung und Analyse.
Kann die Progenesis QI Software zur Verarbeitung anderer Massenspektrometriedaten verwendet werden?
Ja, die Progenesis QI Software ist mit Massenspektrometriedaten kompatibel, die in ein gängiges mzML-Format konvertiert wurden, was eine nahtlose Datenanalyse ermöglicht.
Wie benutzerfreundlich ist die Progenesis QI Software für Wissenschaftler und Labortechniker?
Die Progenesis QI Software wurde mit einer benutzerfreundlichen Oberfläche entwickelt, die es Wissenschaftlern und Labortechnikern erleichtert, komplexe Massenspektrometriedaten zu durchsuchen und zu analysieren.
Kann die Progenesis QI Software große Datensätze effizient verarbeiten?
Ja, die Progenesis QI Software ist für die effiziente Verarbeitung großer Datensätze ausgelegt und ermöglicht so eine schnelle und genaue Analyse von Massenspektrometriedaten.
Bietet die Progenesis QI Software statistische Analysetools?
Ja, die Progenesis QI Software bietet gebräuchliche statistische Analysetools, mit denen Wissenschaftler und Labortechniker detaillierte statistische Analysen an ihren Massenspektrometriedaten durchführen können.
Gibt es technischen Support für Benutzer der Progenesis QI Software?
Ja, Benutzern der Progenesis QI Software steht technischer Support zur Verfügung, um sicherzustellen, dass Wissenschaftler und Labortechniker bei Bedarf Zugriff auf Hilfe und Beratung haben.
