创新数据科技,探索未知前沿

天然产物标准品不易获得,其研究数据复杂且庞大,需要前沿的数据处理技术,来深入挖掘样品中隐藏的信息。

沃特世具有多样的数据处理软件、技术及数据库,能够帮助天然产物研究人员简化工作流程,深入探索信息。

| UNIFI 软件及数据库 |

UNIFI 软件具有多样的工作流程,包括已知物与未知物鉴定、代谢物鉴定、定量等。 并且其配备强大的符合天然产物学家使用习惯的数据库( 包括中药、微生物、植物等), 是基于天然产物来源的数据库。 其数据库包含中文名、拉丁名、化合物分类等信息,可根据需要灵活选择搜库标签,从而提高鉴定准确率。

| 分子网络技术及数据库 |

对于天然产物未知物鉴定,仅仅依靠搜库难以满足需求。 因此需要依靠更前沿的技术来深度挖掘样品信息,减少低含量未知成分的信息遗漏。

沃特世具有先进的分子网络数据挖掘技术,搭载在云平台不断更新的分子网络数据库,可以对样品进行深度挖掘,探索未知信息。

■ GNPS

GNPS (Global Natural Product Social Molecular Networking) 是基于全球130 个国家,4 万多名科学家共建的分子网络数据库云平台。 通过二级谱图的相似性,我们可以构建样品的分子网络,从而从已知成分不断解锁未知成分信息。

■ Natural Products Atlas

Natural Products Atlas 数据库集成了文献与专利报道的微生物相关化合物信息,基于分子网络与大数据互联技术,构建了化合物维度、化学簇维度、节点网络维度、全局大数据维度等不同维度的信息平台。 通过交互技术,可以实现化合物信息任意维度的深度挖掘。

Natural Products Atlas 除包含常规数据库中的化合物名称、分子式、结构等信息外,还包含了天然产物来源的分类学、全合成路线、分离路径等信息,是目前包含微生物化学成分最全的数据库,并且其可以嵌入沃特世特有软件UNIFI 及Progenesis QI 的流程,从而实现天然产物不同应用方向的智能分析流程。

| Progenesis QI 软件及多组学数据处理平台 |

对于组学分析,Progenesis QI 软件拥有“一站式”的完整流程,从峰对齐、识别,再到化学计量学与通路分析,所有组学复杂数据轻松完成处理工作。

对于多组学,沃特世拥有MetaCore 多组学平台,可以将代谢组学、脂质组学、蛋白组学等多组学平台数据进行整合分析,从而对样品获得更深刻的认知。

 

应用案例

中药

  • 中药成分及代谢物表征
  1. UNIFI 及Progenesis QI 软件鉴定复方丹蛭片代谢成分(Mi, Nan, et al. Journal of pharmaceutical and biomedical analysis, 2019.)
  2. 2D LC/UHPSFC-Q-TOF/MS 及GNPS 分子网络技术鉴定蟾酥中蟾蜍二烯羟酸内酯类成分(Wei, Wenlong, et al. Journal of Chromatography A, 2019.)
  • 中药组学
  1. Progenesis QI 软件研究甘遂急性毒性致结肠源性尿毒症(Yang, Zhou, et al. Journal of Chromatography B, 2016.)
  • 中药质量控制
  1. HILIC/QTOF MS 及Progenesis QI 软件鉴别广地龙与沪地龙(Zhang, Jingxian, et al. Analytical and bioanalytical chemistry, 2016.)
  2. Progenesis QI 软件分析血栓通注射液与血塞通注射液的成分差异(Yao, Changliang, et al. Journal of separation science, 2017.)

 

植物

  • 植物成分表征
  1. GNPS 分子网络技术表征鼠李科植物代谢物(Kang, Kyo Bin, et al. The Plant Journal, 2019.)
  2. UNIFI 软件鉴定花生茎叶提取物成分(Deng, Lei, et al. Journal of Mass Spectrometry, 2016.)
  • 植物抗逆
  1. Progensis QI 软件研究大麦低硫胁迫代谢组学(Ghosson, Hikmat, et al. Plant Methods, 2018.)
  • 农林作物品质研究
  1. Progenesis QI 软件研究紫叶茶叶色变化的机理(Shen, Jiazhi, et al. Horticulture research, 2018.)

 

微生物

  • 微生物代谢物分析
  1. GNPS 分子网络技术发现放线菌中活性代谢物(Lu, Qinpei, et al. The Journal of Antibiotics, 2019.)
  2. 利用NP Atlas 数据库研究短尾乌贼卵共生菌防御真菌侵染机制(Kerwin, Allison H., et al. Mbio, 2019.)
  • 微生物与人体疾病及营养研究
  1. Progensis QI 软件分析脾阳虚患者肠道菌群代谢(Lin, Zhang, et al. Scientific Reports, 2018.)
  • 微生物与环境生态
  1. Progenesis QI 软件分析厌氧废水反应器上清液中的微生物代谢产物(Tipthara, Phornpimon, et al. Journal of Proteome Research, 2017.)
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